More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0720 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 446 aa  842    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0720  FAD-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 416 aa  843    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  51.69 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  51.82 
 
 		 415 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  51.34 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  52.91 
 
 		 416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  52.91 
 
 		 416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  49.64 
 
 		 415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  51.7 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  51.46 
 
 		 410 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3604  FAD dependent oxidoreductase  50.85 
 
 		 413 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  48.91 
 
 		 413 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  50.49 
 
 		 417 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  52.67 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  48.42 
 
 		 413 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0629  FAD dependent oxidoreductase  50.12 
 
 		 440 aa  381  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  52.91 
 
 		 410 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1655  D-amino-acid dehydrogenase  49.27 
 
 		 414 aa  378  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0719166  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5251  FAD dependent oxidoreductase  50.12 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3334  D-amino-acid dehydrogenase  50.12 
 
 		 413 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5033  D-amino-acid dehydrogenase  50.12 
 
 		 413 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  50.73 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  49.76 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  50 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1840  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  50.12 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  48.54 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  47.46 
 
 		 414 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  47.46 
 
 		 414 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  47.46 
 
 		 414 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  45.5 
 
 		 416 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  49.64 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  47.46 
 
 		 414 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  46.23 
 
 		 416 aa  365  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  48.3 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  45.99 
 
 		 416 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0770  FAD-dependent oxidoreductase  50.12 
 
 		 507 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2137  D-amino-acid dehydrogenase  50.12 
 
 		 483 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0860  FAD-dependent oxidoreductase  50.12 
 
 		 414 aa  360  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  47.45 
 
 		 413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1724  FAD dependent oxidoreductase  49.15 
 
 		 414 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  47.57 
 
 		 414 aa  349  4e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3940  D-amino-acid dehydrogenase  46.84 
 
 		 414 aa  349  6e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401149  hitchhiker  0.00412438 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  46.12 
 
 		 414 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0367  D-amino-acid dehydrogenase  46.36 
 
 		 414 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0822  FAD dependent oxidoreductase  46.6 
 
 		 414 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  0.0469773 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0850  D-amino-acid dehydrogenase  46.36 
 
 		 414 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  46.12 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  40.53 
 
 		 417 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 		 421 aa  332  7.000000000000001e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  39.56 
 
 		 415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  39.56 
 
 		 415 aa  319  7e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4795  putative D-amino-acid dehydrogenase  41.31 
 
 		 412 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3891  FAD dependent oxidoreductase  38.04 
 
 		 410 aa  282  9e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  39.86 
 
 		 418 aa  262  8.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4628  D-amino-acid dehydrogenase  37.71 
 
 		 412 aa  256  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.732848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2064  FAD dependent oxidoreductase  35 
 
 		 414 aa  209  6e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 		 420 aa  190  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  32.95 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 		 425 aa  186  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 412 aa  183  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  33.57 
 
 		 423 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 		 416 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5562  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 		 425 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 427 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  30.16 
 
 		 427 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  31.75 
 
 		 422 aa  179  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 413 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 420 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  29.9 
 
 		 428 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 432 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.64 
 
 		 421 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 423 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  29.53 
 
 		 446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  30.68 
 
 		 409 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  31.84 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  29.13 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  31.59 
 
 		 413 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.86 
 
 		 420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 430 aa  152  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  29.36 
 
 		 415 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 416 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  29.98 
 
 		 416 aa  143  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  29.98 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  29.55 
 
 		 435 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  27.65 
 
 		 420 aa  139  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 411 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 415 aa  138  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  29.76 
 
 		 434 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  29.98 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  29.98 
 
 		 409 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  30.88 
 
 		 420 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 409 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  26.41 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>