More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6455 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 409 aa  799    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  88.51 
 
 		 409 aa  680    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  88.51 
 
 		 409 aa  680    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  65.53 
 
 		 409 aa  541  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  64.15 
 
 		 410 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  42.93 
 
 		 434 aa  300  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  43.52 
 
 		 413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  44.19 
 
 		 413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  43 
 
 		 414 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 		 420 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  38.54 
 
 		 416 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  39.12 
 
 		 423 aa  243  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 		 432 aa  239  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 431 aa  237  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  37.72 
 
 		 435 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  33.57 
 
 		 446 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 		 425 aa  234  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  35.85 
 
 		 416 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 424 aa  229  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  34.49 
 
 		 411 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  35.19 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 		 416 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 		 416 aa  226  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 		 411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 420 aa  226  6e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  35.28 
 
 		 421 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 		 413 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  36.23 
 
 		 435 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  37.16 
 
 		 413 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  34.68 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  32.51 
 
 		 415 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  35.25 
 
 		 428 aa  220  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  37.23 
 
 		 420 aa  219  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  33.33 
 
 		 422 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  36.88 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  37.23 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 		 411 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  39.24 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.42 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  36.49 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  32.85 
 
 		 415 aa  212  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  34.89 
 
 		 440 aa  210  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  31.4 
 
 		 427 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 426 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  36.56 
 
 		 434 aa  202  7e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  35.5 
 
 		 424 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  30.64 
 
 		 405 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 		 415 aa  196  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  36.21 
 
 		 406 aa  193  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  30.1 
 
 		 416 aa  193  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  38.16 
 
 		 423 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  35.65 
 
 		 432 aa  190  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  32.45 
 
 		 418 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 		 430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  33.75 
 
 		 427 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 419 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  31.64 
 
 		 417 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  32.45 
 
 		 413 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  31.4 
 
 		 417 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5251  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 413 aa  166  8e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 421 aa  166  9e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3334  D-amino-acid dehydrogenase  33.41 
 
 		 413 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5033  D-amino-acid dehydrogenase  33.41 
 
 		 413 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 		 415 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  27.07 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 415 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0629  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 440 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1840  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  33.57 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3604  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  29.5 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  36.27 
 
 		 422 aa  160  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 		 416 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  23.9 
 
 		 417 aa  159  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  30.41 
 
 		 433 aa  159  8e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 417 aa  159  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.43 
 
 		 415 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 415 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  29.26 
 
 		 416 aa  156  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1724  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 414 aa  153  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 416 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  28.06 
 
 		 417 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3470  D-amino-acid dehydrogenase  34.29 
 
 		 458 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 410 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 414 aa  150  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  30.05 
 
 		 418 aa  150  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 414 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 414 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  28.71 
 
 		 410 aa  149  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3967  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.13 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194472  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 416 aa  146  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0860  FAD-dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 414 aa  146  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>