More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3464 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 416 aa  794    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  51.25 
 
 		 424 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  45.28 
 
 		 416 aa  348  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  49.88 
 
 		 422 aa  330  4e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  43.36 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  42.36 
 
 		 420 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  42.32 
 
 		 435 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  44.1 
 
 		 420 aa  309  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  41.32 
 
 		 416 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  41.96 
 
 		 416 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  43.28 
 
 		 413 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  40.3 
 
 		 428 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  41.75 
 
 		 425 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 413 aa  285  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  40.29 
 
 		 427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  44.11 
 
 		 406 aa  283  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 		 427 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  42.65 
 
 		 431 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  42.23 
 
 		 421 aa  280  4e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  39.02 
 
 		 423 aa  270  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  40.53 
 
 		 409 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  36.78 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  35.65 
 
 		 446 aa  258  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  35.59 
 
 		 420 aa  256  5e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  40.34 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 		 432 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 423 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  39.45 
 
 		 427 aa  250  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  39.2 
 
 		 430 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  34.37 
 
 		 427 aa  239  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  35.12 
 
 		 405 aa  237  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  36.39 
 
 		 415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  40.42 
 
 		 434 aa  233  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  39.01 
 
 		 438 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  41.05 
 
 		 426 aa  232  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  37.35 
 
 		 434 aa  231  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 		 410 aa  229  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  37.11 
 
 		 435 aa  229  9e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  35.18 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  36.59 
 
 		 415 aa  223  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 		 430 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 		 411 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  35.58 
 
 		 440 aa  219  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  36.96 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  40.19 
 
 		 409 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  40.19 
 
 		 409 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  41.97 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  35.16 
 
 		 416 aa  212  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 411 aa  211  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  38.52 
 
 		 432 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 414 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 		 415 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  37.86 
 
 		 413 aa  203  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 		 415 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  37.62 
 
 		 413 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  32.85 
 
 		 418 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  33.57 
 
 		 420 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  29.6 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 		 440 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 416 aa  186  7e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  32.45 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 417 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  31.81 
 
 		 417 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  28.87 
 
 		 415 aa  179  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 415 aa  177  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  32.22 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  31.14 
 
 		 433 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 416 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 414 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 417 aa  172  9e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.75 
 
 		 428 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 415 aa  170  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  32.69 
 
 		 410 aa  169  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  31.55 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2074  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.2 
 
 		 422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00739126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  31.96 
 
 		 414 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  30.34 
 
 		 416 aa  164  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  26.27 
 
 		 421 aa  164  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2093  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.94 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.59754  normal  0.0350619 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  26.17 
 
 		 462 aa  159  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  30.36 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 414 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1724  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 		 414 aa  153  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>