More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0793 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 		 438 aa  863    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  62.15 
 
 		 424 aa  528  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  63.92 
 
 		 432 aa  491  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  58.18 
 
 		 434 aa  449  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  48.58 
 
 		 435 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  53.27 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  51.76 
 
 		 423 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  42.62 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 		 420 aa  296  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  39.72 
 
 		 421 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  39.67 
 
 		 427 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  39.34 
 
 		 427 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  37.65 
 
 		 415 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  40.94 
 
 		 423 aa  256  7e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  36.26 
 
 		 415 aa  249  5e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  36.66 
 
 		 409 aa  239  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  38.73 
 
 		 416 aa  236  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  35.19 
 
 		 420 aa  225  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  35.19 
 
 		 420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 		 423 aa  219  6e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 		 413 aa  219  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  40.52 
 
 		 413 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 		 409 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  39.54 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  40.78 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 		 410 aa  216  8e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  33.57 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 		 420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 		 416 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  33.18 
 
 		 416 aa  210  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  33.33 
 
 		 413 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  37.44 
 
 		 409 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  37.44 
 
 		 409 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  33.8 
 
 		 422 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 		 435 aa  206  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 		 425 aa  205  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  33.9 
 
 		 424 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 412 aa  202  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  34.18 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  37.83 
 
 		 422 aa  200  5e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  35.03 
 
 		 406 aa  197  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.41 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  32.55 
 
 		 427 aa  184  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  36.34 
 
 		 440 aa  182  8.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  34.38 
 
 		 434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 		 415 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  35.12 
 
 		 420 aa  179  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  30.88 
 
 		 405 aa  179  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 		 430 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 415 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  34.8 
 
 		 415 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 415 aa  169  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  31.59 
 
 		 411 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 418 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  28.05 
 
 		 416 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  30.7 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 413 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  31.91 
 
 		 433 aa  143  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 415 aa  141  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  30.09 
 
 		 417 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  25.65 
 
 		 462 aa  138  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 415 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 441 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5562  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 425 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  28.91 
 
 		 417 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 414 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1840  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  32.51 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 414 aa  131  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0822  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  0.0469773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3334  D-amino-acid dehydrogenase  32.21 
 
 		 413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5033  D-amino-acid dehydrogenase  32.21 
 
 		 413 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 414 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4821  D-amino-acid dehydrogenase  31.37 
 
 		 419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052408 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3604  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5251  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 414 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.57 
 
 		 428 aa  129  8.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  29.06 
 
 		 416 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  29.75 
 
 		 415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0367  D-amino-acid dehydrogenase  32.95 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0850  D-amino-acid dehydrogenase  32.95 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  30.23 
 
 		 413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 416 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0629  FAD dependent oxidoreductase  31.85 
 
 		 440 aa  126  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 414 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  31.64 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  28.83 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  32.27 
 
 		 414 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>