More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5266 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
427 aa  859    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  91.89 
 
 
430 aa  744    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 
413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 
416 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  40.34 
 
 
416 aa  264  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  35.84 
 
 
416 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  37.74 
 
 
423 aa  258  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  37.17 
 
 
420 aa  257  3e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  36.12 
 
 
427 aa  249  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  36.87 
 
 
431 aa  248  2e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  35.65 
 
 
427 aa  247  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1416  D-amino-acid dehydrogenase  34.16 
 
 
424 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000529434  normal  0.0258271 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  35.84 
 
 
416 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  38.75 
 
 
422 aa  243  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  33.42 
 
 
420 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3322  FAD dependent oxidoreductase  34.6 
 
 
435 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  32.91 
 
 
420 aa  230  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  33.74 
 
 
413 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  35.01 
 
 
435 aa  225  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 
409 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  35.1 
 
 
424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.21 
 
 
421 aa  215  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  35.09 
 
 
406 aa  213  5.999999999999999e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 
420 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  34.18 
 
 
428 aa  211  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 
423 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 
410 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  32.53 
 
 
432 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 
434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  32.21 
 
 
422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  34.63 
 
 
409 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0793  D-amino-acid dehydrogenase  33.88 
 
 
438 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.186326  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  34.63 
 
 
409 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  30.27 
 
 
405 aa  196  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3651  FAD dependent oxidoreductase  35.49 
 
 
426 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02824  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6455  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 
409 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470028  normal  0.375061 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
419 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 
425 aa  193  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  29.76 
 
 
415 aa  193  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  30.42 
 
 
446 aa  192  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2554  D-amino-acid dehydrogenase  35.2 
 
 
434 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100435  hitchhiker  0.00601757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 
412 aa  190  5e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3636  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 
423 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  30.48 
 
 
415 aa  186  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  30.28 
 
 
427 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3676  D-amino-acid dehydrogenase  33.02 
 
 
432 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
430 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 
414 aa  182  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
416 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 
416 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  30.84 
 
 
418 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 
417 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  32.3 
 
 
428 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  31.8 
 
 
417 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1255  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 
415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.621856  normal  0.317392 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  31.08 
 
 
418 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
415 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  30.83 
 
 
417 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
421 aa  173  5.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4136  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 
415 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1282  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 
415 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.783246  normal  0.547311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 
411 aa  170  4e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  30.92 
 
 
440 aa  169  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  28.75 
 
 
413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
411 aa  164  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  30.05 
 
 
416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 
414 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  28.86 
 
 
413 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 
414 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 
414 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  29.16 
 
 
416 aa  160  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  29.78 
 
 
433 aa  160  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 
416 aa  159  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  28.67 
 
 
417 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  29.81 
 
 
416 aa  159  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  30.39 
 
 
420 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  26.52 
 
 
417 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 
416 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0499  FAD dependent oxidoreductase  30.26 
 
 
415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.57 
 
 
428 aa  154  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2137  D-amino-acid dehydrogenase  32.38 
 
 
483 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0770  FAD-dependent oxidoreductase  31.97 
 
 
507 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 
417 aa  152  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  30.77 
 
 
410 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0860  FAD-dependent oxidoreductase  31.97 
 
 
414 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 
437 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
410 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.14 
 
 
415 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 
441 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  29.05 
 
 
413 aa  150  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  27.32 
 
 
415 aa  149  7e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  28.03 
 
 
416 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
415 aa  146  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 
415 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1840  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  30.6 
 
 
435 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1218  FAD dependent oxidoreductase  26.12 
 
 
415 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
414 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  29.48 
 
 
413 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>