More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4795 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4795  putative D-amino-acid dehydrogenase  100 
 
 		 412 aa  835    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  48.66 
 
 		 415 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1655  D-amino-acid dehydrogenase  49.88 
 
 		 414 aa  411  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0719166  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  50 
 
 		 415 aa  411  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  48.18 
 
 		 415 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 410 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3891  FAD dependent oxidoreductase  45.95 
 
 		 410 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  46.83 
 
 		 417 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  48.28 
 
 		 416 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  48.28 
 
 		 416 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  49.51 
 
 		 416 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  47.82 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  47.57 
 
 		 417 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4628  D-amino-acid dehydrogenase  45.26 
 
 		 412 aa  362  8e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.732848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1724  FAD dependent oxidoreductase  47.3 
 
 		 414 aa  359  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  47.19 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  46.34 
 
 		 433 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  46.6 
 
 		 413 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  46.72 
 
 		 418 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  46.6 
 
 		 413 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0822  FAD dependent oxidoreductase  47.19 
 
 		 414 aa  355  5e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  0.0469773 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  47.2 
 
 		 410 aa  355  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  46.45 
 
 		 414 aa  353  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  46.7 
 
 		 414 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  44.9 
 
 		 416 aa  352  5e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0367  D-amino-acid dehydrogenase  47.19 
 
 		 414 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0850  D-amino-acid dehydrogenase  47.19 
 
 		 414 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  46.21 
 
 		 414 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  46.12 
 
 		 417 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3940  D-amino-acid dehydrogenase  46.45 
 
 		 414 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401149  hitchhiker  0.00412438 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 		 413 aa  349  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  44.66 
 
 		 416 aa  348  8e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  44.17 
 
 		 416 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  48.04 
 
 		 414 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1840  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  44.85 
 
 		 435 aa  345  7e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  45.48 
 
 		 414 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0629  FAD dependent oxidoreductase  46.6 
 
 		 440 aa  343  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  45.48 
 
 		 414 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2064  FAD dependent oxidoreductase  44.77 
 
 		 414 aa  343  4e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  45.85 
 
 		 414 aa  342  9e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  44.99 
 
 		 414 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3334  D-amino-acid dehydrogenase  46.35 
 
 		 413 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281822  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5033  D-amino-acid dehydrogenase  46.35 
 
 		 413 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5251  FAD dependent oxidoreductase  46.35 
 
 		 413 aa  338  7e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3604  FAD dependent oxidoreductase  45.09 
 
 		 413 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  43.52 
 
 		 414 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2137  D-amino-acid dehydrogenase  45.34 
 
 		 483 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0770  FAD-dependent oxidoreductase  45.34 
 
 		 507 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0860  FAD-dependent oxidoreductase  45.34 
 
 		 414 aa  332  5e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  41.29 
 
 		 421 aa  325  1e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  39.56 
 
 		 417 aa  319  5e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  38.94 
 
 		 415 aa  313  3.9999999999999997e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0720  FAD-dependent oxidoreductase  41.81 
 
 		 416 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  41.81 
 
 		 446 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  38.22 
 
 		 415 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  36.74 
 
 		 418 aa  247  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5562  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 		 425 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  30.75 
 
 		 431 aa  173  5e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  32.12 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 413 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 		 420 aa  166  8e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  31.34 
 
 		 423 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.13 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  27.87 
 
 		 427 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  28.33 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  32.08 
 
 		 413 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  31.83 
 
 		 413 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  30.64 
 
 		 423 aa  155  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  27.06 
 
 		 428 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  26.52 
 
 		 415 aa  149  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  28.98 
 
 		 446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 425 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 420 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  28.67 
 
 		 413 aa  143  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  29.56 
 
 		 406 aa  143  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1318  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.25 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 409 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6619  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 410 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 		 427 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 		 434 aa  139  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  26.25 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  29.09 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1434  D-amino-acid dehydrogenase  29.06 
 
 		 409 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221465  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 416 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6394  D-amino-acid dehydrogenase  29.06 
 
 		 409 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6396  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 424 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1330  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.27 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000545747  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1945  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.27 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.290196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.4 
 
 		 420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3174  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 418 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2064  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 422 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0107883  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2001  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.03 
 
 		 432 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.21848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1515  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.03 
 
 		 432 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.684243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.18 
 
 		 428 aa  129  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1941  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.03 
 
 		 432 aa  129  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.377151  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>