More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4726 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 389 aa  754    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  61.98 
 
 		 393 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  58.12 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  53.35 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  51.31 
 
 		 389 aa  309  4e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  49.19 
 
 		 379 aa  252  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  32.19 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  32.19 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  31.93 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  31.93 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  31.76 
 
 		 391 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  31.93 
 
 		 391 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 		 401 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  31.5 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  31.5 
 
 		 391 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  31.2 
 
 		 375 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  32.29 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  34.44 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  33.33 
 
 		 378 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  34.39 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  34.71 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 375 aa  137  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  33.15 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 375 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 375 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4561  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 		 375 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 		 375 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  32.98 
 
 		 374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2066  oxidoreductase, FAD-binding family protein  35.5 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.81 
 
 		 390 aa  123  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  31.25 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  33.25 
 
 		 440 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  27.4 
 
 		 365 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  31.51 
 
 		 374 aa  119  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 378 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  32.3 
 
 		 411 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 379 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.14 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.41 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.85 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  31.85 
 
 		 405 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 367 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.77 
 
 		 417 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  30.59 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  28.45 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.85 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.85 
 
 		 369 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 372 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.64 
 
 		 369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 383 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.85 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.26 
 
 		 369 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.85 
 
 		 369 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  24.39 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 983 aa  106  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  30.61 
 
 		 496 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  35.27 
 
 		 371 aa  106  6e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  24.12 
 
 		 369 aa  106  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.58 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  32.34 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  31 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  29.4 
 
 		 356 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1888  oxidoreductase, FAD-binding family protein  34.22 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0571  FAD-dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0474  FAD-dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 500 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  32.97 
 
 		 376 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 500 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 393 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  31.23 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  25.62 
 
 		 460 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  30.43 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0875  putative oxidoreductase  32.55 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960065  normal  0.263987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  32.33 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 360 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  31.01 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1418  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.16 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0869563  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2196  oxidoreductase, FAD-binding family protein  33.16 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270908  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 390 aa  100  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  29.17 
 
 		 416 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 442 aa  99.8  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 390 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 984 aa  99.8  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 		 373 aa  99.4  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5219  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 368 aa  99  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 378 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>