More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1841 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 374 aa  747    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  60.66 
 
 		 371 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  60.77 
 
 		 375 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  62.22 
 
 		 375 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  60.22 
 
 		 375 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  60.5 
 
 		 375 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  59.13 
 
 		 375 aa  411  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  59.67 
 
 		 375 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  59.67 
 
 		 375 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  59.83 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2066  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.94 
 
 		 377 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5219  FAD dependent oxidoreductase  59.29 
 
 		 368 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0571  FAD-dependent oxidoreductase  60.56 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0474  FAD-dependent oxidoreductase  60.28 
 
 		 377 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1888  oxidoreductase, FAD-binding family protein  60.28 
 
 		 377 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1418  oxidoreductase, FAD-binding family protein  60.06 
 
 		 380 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0869563  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2196  oxidoreductase, FAD-binding family protein  60.06 
 
 		 380 aa  360  2e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0882  oxidoreductase, FAD-binding family protein  59.56 
 
 		 383 aa  358  7e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  51.51 
 
 		 378 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  49.73 
 
 		 379 aa  309  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  47.4 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4561  FAD dependent oxidoreductase  48.78 
 
 		 375 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0875  putative oxidoreductase  48.86 
 
 		 376 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960065  normal  0.263987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 398 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.61 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 393 aa  109  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 401 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  24.28 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  24.02 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  24.02 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  23.96 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  24.02 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  24.02 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  24.02 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  24.02 
 
 		 391 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  24.51 
 
 		 375 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  29.36 
 
 		 379 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  26.85 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.83 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  24.07 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 388 aa  90.1  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.3 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  26.07 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.98 
 
 		 382 aa  85.9  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.08 
 
 		 361 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  27.51 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  28.91 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  25.66 
 
 		 439 aa  83.2  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  27.46 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  26.72 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1981  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.47 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.200719  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  26.11 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.93 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.64 
 
 		 369 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  23.56 
 
 		 378 aa  79.3  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  27.59 
 
 		 368 aa  79.3  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 411 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  27.08 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  29.52 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  26.24 
 
 		 386 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.91 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.91 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  23.92 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  27.44 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.19 
 
 		 369 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  25.74 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.66 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 960 aa  75.1  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  25.07 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  26.61 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  24.65 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  23.23 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  29.41 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0106  FAD dependent oxidoreductase  25.16 
 
 		 416 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  29.61 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  22.78 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  25.13 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  24.59 
 
 		 383 aa  72.8  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  27.69 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.26 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  28.8 
 
 		 392 aa  72.8  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  26.49 
 
 		 420 aa  72  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2005  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.49 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  24.26 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  22.38 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  23.94 
 
 		 418 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  24.54 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  24.55 
 
 		 375 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>