More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_5037 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
360 aa  733    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  68.25 
 
 
379 aa  525  1e-148  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0199  FAD dependent oxidoreductase  59.65 
 
 
366 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0537  FAD dependent oxidoreductase  60.11 
 
 
369 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0520  FAD dependent oxidoreductase  59.83 
 
 
369 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  53.37 
 
 
389 aa  393  1e-108  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 
381 aa  355  6.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1677  hypothetical protein  46.65 
 
 
365 aa  297  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.32351  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  30.17 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  30.17 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2673  D-amino acid oxidase  30.25 
 
 
350 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  29.61 
 
 
369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19131  NAD binding site:D-amino acid oxidase  27.72 
 
 
360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.119558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  29.12 
 
 
369 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1796  D-amino acid oxidase  27.17 
 
 
360 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  28.97 
 
 
369 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  28.13 
 
 
369 aa  124  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  29.28 
 
 
369 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  28.77 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  29.01 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  28.77 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  28.65 
 
 
411 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30031  NAD binding site:D-amino acid oxidase  31.71 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.549053 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  29.01 
 
 
369 aa  120  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  28.77 
 
 
371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  28.93 
 
 
440 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  27.75 
 
 
382 aa  119  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1312  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 
368 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21851  NAD binding site:D-amino acid oxidase  26.81 
 
 
370 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  30.77 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  28.13 
 
 
376 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  25.14 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18391  NAD binding site:D-amino acid oxidase  26.42 
 
 
371 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.299081  normal  0.626898 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  26.83 
 
 
372 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  28.69 
 
 
375 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2192  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
375 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  26.18 
 
 
374 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2302  D-amino acid oxidase  31.83 
 
 
302 aa  106  8e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  25.57 
 
 
360 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  26.78 
 
 
405 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  25.9 
 
 
376 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  30.42 
 
 
652 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  30.55 
 
 
666 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.33 
 
 
371 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  29.66 
 
 
367 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  27.73 
 
 
368 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  27.92 
 
 
371 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  27.92 
 
 
371 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  27.92 
 
 
371 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  27.93 
 
 
363 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 
363 aa  100  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  30.26 
 
 
666 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  28.05 
 
 
371 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  25.64 
 
 
365 aa  100  6e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.41 
 
 
371 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 
393 aa  99  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  27.92 
 
 
371 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 
379 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  28.65 
 
 
398 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
371 aa  97.8  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18941  NAD binding site:D-amino acid oxidase  26.65 
 
 
360 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  27.48 
 
 
371 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  27.48 
 
 
371 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  26.1 
 
 
363 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  25.2 
 
 
367 aa  94.7  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  28.29 
 
 
410 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  26.3 
 
 
1033 aa  95.1  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  25.42 
 
 
404 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  27.78 
 
 
372 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 
380 aa  94  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  25.75 
 
 
401 aa  94  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  27.84 
 
 
384 aa  93.2  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
366 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 
398 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  25.7 
 
 
368 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  28.53 
 
 
373 aa  92  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  27.64 
 
 
376 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.32 
 
 
417 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  27.64 
 
 
376 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.93 
 
 
367 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  27.79 
 
 
391 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  29.41 
 
 
652 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  26.56 
 
 
371 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  28.2 
 
 
360 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 
373 aa  90.1  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1225  oxidoreductase, DadA family protein/D-amino acid oxidase  26.22 
 
 
363 aa  90.1  5e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  28.93 
 
 
392 aa  89.7  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  34.12 
 
 
364 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 
385 aa  89.4  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 
377 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  26.21 
 
 
385 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  26.65 
 
 
361 aa  88.2  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 
365 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  26.97 
 
 
356 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 
485 aa  87  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  27.27 
 
 
402 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>