More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4668 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 379 aa  756    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4561  FAD dependent oxidoreductase  77.75 
 
 		 375 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0875  putative oxidoreductase  76.64 
 
 		 376 aa  494  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960065  normal  0.263987 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  59.24 
 
 		 375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  59.51 
 
 		 375 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  59.51 
 
 		 375 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  60.27 
 
 		 375 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  59.24 
 
 		 375 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 		 375 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  61.14 
 
 		 375 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  56.13 
 
 		 371 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2066  oxidoreductase, FAD-binding family protein  58.42 
 
 		 377 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  56.68 
 
 		 371 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1888  oxidoreductase, FAD-binding family protein  58.15 
 
 		 377 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0474  FAD-dependent oxidoreductase  58.15 
 
 		 377 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0571  FAD-dependent oxidoreductase  57.88 
 
 		 377 aa  339  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  51.08 
 
 		 374 aa  338  7e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5219  FAD dependent oxidoreductase  53.57 
 
 		 368 aa  333  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1418  oxidoreductase, FAD-binding family protein  57.41 
 
 		 380 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0869563  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2196  oxidoreductase, FAD-binding family protein  57.41 
 
 		 380 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0882  oxidoreductase, FAD-binding family protein  56.95 
 
 		 383 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  46.2 
 
 		 370 aa  322  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  50.8 
 
 		 378 aa  316  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  33.42 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 393 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  31.78 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 401 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  25.06 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  24.81 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  25.77 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 		 389 aa  113  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  24.55 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  25 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  24.55 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  25 
 
 		 391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  25 
 
 		 391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.04 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  28.05 
 
 		 390 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 419 aa  106  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.17 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  25.45 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1727  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  28.8 
 
 		 420 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  24.18 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  26.86 
 
 		 393 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 386 aa  99.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  31.07 
 
 		 382 aa  99.8  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.94 
 
 		 378 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  32.3 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  29.43 
 
 		 420 aa  92.8  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  29.85 
 
 		 392 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  27.44 
 
 		 374 aa  90.5  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 383 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 383 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  27.18 
 
 		 375 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  26.79 
 
 		 363 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  25.27 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.39 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  28.46 
 
 		 388 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  27.87 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  31.42 
 
 		 349 aa  84.7  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  23.78 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  25.2 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.03 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  24.94 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  29.43 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  29.12 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 		 383 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  26.57 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  27.47 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0222  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000376254  normal  0.0113396 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  25.98 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  29.85 
 
 		 384 aa  79.7  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 375 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  27.44 
 
 		 404 aa  79.3  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  26.98 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  28.69 
 
 		 371 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2712  FAD dependent oxidoreductase  26.08 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0746  putative oxidoreductase  26.81 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  27.53 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  25.64 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  24.6 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  25.2 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  29.63 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.88 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  27.45 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.47 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.81 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>