More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2066 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II2066  oxidoreductase, FAD-binding family protein  100 
 
 
377 aa  742    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0474  FAD-dependent oxidoreductase  92.04 
 
 
377 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.348164  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1888  oxidoreductase, FAD-binding family protein  92.04 
 
 
377 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0571  FAD-dependent oxidoreductase  92.31 
 
 
377 aa  621  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.105035  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1418  oxidoreductase, FAD-binding family protein  91.05 
 
 
380 aa  614  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0869563  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2196  oxidoreductase, FAD-binding family protein  91.05 
 
 
380 aa  614  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0882  oxidoreductase, FAD-binding family protein  90.34 
 
 
383 aa  608  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  82.61 
 
 
375 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  81.94 
 
 
375 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  81.94 
 
 
375 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  81.94 
 
 
375 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  81.67 
 
 
375 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  81.4 
 
 
375 aa  598  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  83.02 
 
 
375 aa  590  1e-167  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  68.32 
 
 
371 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  68.58 
 
 
371 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  59.94 
 
 
374 aa  408  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5219  FAD dependent oxidoreductase  64.71 
 
 
368 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  56.79 
 
 
379 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4561  FAD dependent oxidoreductase  55.34 
 
 
375 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  50.86 
 
 
370 aa  342  5.999999999999999e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  54.14 
 
 
378 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0875  putative oxidoreductase  56.52 
 
 
376 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.960065  normal  0.263987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 
393 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 
398 aa  142  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  31.75 
 
 
393 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  32.4 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  32.77 
 
 
389 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  34.42 
 
 
389 aa  119  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  25.53 
 
 
391 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  25.26 
 
 
391 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  25.26 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  25.26 
 
 
391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  25.26 
 
 
391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  25.26 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  25.26 
 
 
391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 
391 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  25.21 
 
 
375 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 
401 aa  106  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  25 
 
 
330 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 
427 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  31.22 
 
 
371 aa  100  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  29.77 
 
 
363 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29.82 
 
 
376 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  28.42 
 
 
368 aa  99.8  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  32.04 
 
 
960 aa  99.4  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  33.69 
 
 
361 aa  99  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  27.47 
 
 
371 aa  96.7  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  28.38 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 
417 aa  93.6  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  30.98 
 
 
364 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  27.7 
 
 
361 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  30.81 
 
 
375 aa  93.2  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2102  D-amino-acid dehydrogenase  33.84 
 
 
427 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.3 
 
 
417 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  28.8 
 
 
368 aa  90.5  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 
376 aa  90.5  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.97 
 
 
382 aa  90.1  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  28.67 
 
 
416 aa  89.4  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.68 
 
 
378 aa  89.4  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 
983 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.3 
 
 
417 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.99 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  28.95 
 
 
418 aa  87  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  30.52 
 
 
404 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2547  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.84 
 
 
434 aa  86.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1324  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 
375 aa  86.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  25.46 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 
984 aa  85.9  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  25.75 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  27.19 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 
386 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0926  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.77 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.531144  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0222  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.55 
 
 
428 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0408  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.55 
 
 
428 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2864  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.55 
 
 
428 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.367842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0927  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.55 
 
 
428 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2551  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.55 
 
 
428 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3955  FAD dependent oxidoreductase  24.82 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3659  FAD dependent oxidoreductase  28.62 
 
 
423 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 
365 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  29.82 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  29.82 
 
 
376 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1656  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.31 
 
 
428 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0867  D-amino acid dehydrogenase small subunit  30.46 
 
 
429 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.872467  normal  0.695937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0796  D-amino acid dehydrogenase small subunit  26.45 
 
 
429 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.661102  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
440 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  27.54 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2974  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.31 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2925  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.31 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  30.64 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  25.4 
 
 
394 aa  80.5  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  26.88 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>