More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1170 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 367 aa  731    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  61.03 
 
 		 371 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  47.63 
 
 		 385 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 378 aa  325  7e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  45.08 
 
 		 378 aa  322  5e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  47.14 
 
 		 378 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  48.75 
 
 		 376 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  46.2 
 
 		 383 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  46.13 
 
 		 356 aa  312  5.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  46 
 
 		 378 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  48.56 
 
 		 371 aa  309  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  45.43 
 
 		 378 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  47.14 
 
 		 374 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  44.51 
 
 		 375 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  46.29 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  46.29 
 
 		 374 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  45.14 
 
 		 372 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  43.89 
 
 		 380 aa  290  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  43.44 
 
 		 375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  42.38 
 
 		 390 aa  285  7e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  45.43 
 
 		 385 aa  285  8e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  45.43 
 
 		 374 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  41.69 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  40.31 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  38.34 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  27 
 
 		 384 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 983 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  29.95 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 984 aa  110  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  27.92 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  28.19 
 
 		 405 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  27.3 
 
 		 371 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  25.71 
 
 		 417 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  25.14 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  25 
 
 		 417 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  24.46 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  24.46 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  29.32 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.29 
 
 		 378 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  24.86 
 
 		 391 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 395 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 391 aa  96.7  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 393 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 394 aa  96.3  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  24.86 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  24.86 
 
 		 391 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 		 428 aa  95.9  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  31.37 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.56 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  24.86 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 496 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.85 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  24.78 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  24.78 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.78 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  28.68 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 383 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  28.29 
 
 		 361 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 383 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 500 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 386 aa  92.8  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 		 377 aa  92.8  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.27 
 
 		 369 aa  92.8  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  24.49 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  24.49 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 398 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  23.89 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.49 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  25.43 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  27.87 
 
 		 372 aa  91.3  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 500 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.62 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 960 aa  90.9  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  27.13 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  28.46 
 
 		 416 aa  90.5  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.32 
 
 		 369 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  28.65 
 
 		 375 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  27.2 
 
 		 380 aa  89.7  8e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  28.98 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  28.39 
 
 		 410 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 		 382 aa  87.4  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 374 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 384 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  26.49 
 
 		 666 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>