More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0204 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 385 aa  774    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  52.94 
 
 		 356 aa  359  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  50.67 
 
 		 378 aa  356  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  51.47 
 
 		 385 aa  349  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  51.58 
 
 		 378 aa  345  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  51.25 
 
 		 378 aa  344  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  49.48 
 
 		 383 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  49.72 
 
 		 378 aa  338  7e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  51.72 
 
 		 376 aa  324  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  47.98 
 
 		 390 aa  316  5e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  46.94 
 
 		 374 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  47.35 
 
 		 372 aa  303  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  46.94 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  46.94 
 
 		 374 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  47.17 
 
 		 369 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  46.52 
 
 		 371 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 		 374 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  46.95 
 
 		 378 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  43.3 
 
 		 365 aa  277  2e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  45.43 
 
 		 367 aa  276  6e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  42.29 
 
 		 375 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  40.67 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  41.07 
 
 		 375 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  44.12 
 
 		 371 aa  246  4e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  41.02 
 
 		 380 aa  239  8e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 984 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.64 
 
 		 417 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.38 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 390 aa  99.4  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 385 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  29.44 
 
 		 389 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  25.94 
 
 		 419 aa  96.3  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  24.3 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  24.3 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  24.3 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  28.61 
 
 		 361 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 983 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 389 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 		 391 aa  92.8  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  24.05 
 
 		 391 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  23.35 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  23.35 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  27.51 
 
 		 440 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  28.69 
 
 		 393 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  24.75 
 
 		 330 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  26.6 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  26.57 
 
 		 369 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  26.57 
 
 		 369 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 390 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  26.57 
 
 		 369 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.69 
 
 		 378 aa  89.7  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  23.6 
 
 		 391 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  25.14 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  27.09 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  27.65 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  25.43 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  26.29 
 
 		 369 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 398 aa  87.8  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 393 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  26 
 
 		 369 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  26 
 
 		 369 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.32 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  25.85 
 
 		 369 aa  86.3  9e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 389 aa  86.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  29.85 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  25.14 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  25.43 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 960 aa  84  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 386 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  25.76 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5219  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  23.9 
 
 		 375 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  28.31 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  24.36 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  27.27 
 
 		 401 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  27.39 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  30.77 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  26.37 
 
 		 382 aa  79.7  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  26.87 
 
 		 391 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 		 376 aa  79.3  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  23.4 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4833  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.866256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 376 aa  77  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25.53 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3550  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6383  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  29.34 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6616  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.144379 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27740  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.68 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>