More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4416 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 378 aa  764    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  54.47 
 
 		 383 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  56.83 
 
 		 385 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  56.21 
 
 		 378 aa  389  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  54.55 
 
 		 378 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  55.4 
 
 		 378 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  52.84 
 
 		 372 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  51.42 
 
 		 371 aa  342  7e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 367 aa  334  2e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  49.86 
 
 		 374 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  49.58 
 
 		 374 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  49.58 
 
 		 374 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  46.98 
 
 		 390 aa  319  5e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  47.58 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  47.06 
 
 		 378 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  44.76 
 
 		 365 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  48.51 
 
 		 376 aa  310  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  48.46 
 
 		 374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  44.32 
 
 		 364 aa  295  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  45.55 
 
 		 385 aa  291  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  48.32 
 
 		 371 aa  281  9e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  44.72 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  40.87 
 
 		 375 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  40.38 
 
 		 380 aa  266  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  42.23 
 
 		 375 aa  256  6e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 983 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 960 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  28.86 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 393 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  29.58 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  27.37 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 378 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  24.79 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  24.79 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  26.56 
 
 		 389 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  30.06 
 
 		 374 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 378 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 401 aa  106  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  24.51 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  26.37 
 
 		 984 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  24.51 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  24.51 
 
 		 391 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.29 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  23.96 
 
 		 391 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 383 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 383 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  24.23 
 
 		 391 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  25.91 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  24.51 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 385 aa  100  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  24.6 
 
 		 419 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  29.27 
 
 		 371 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 365 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 373 aa  98.2  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  27.51 
 
 		 382 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 398 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.44 
 
 		 369 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.72 
 
 		 369 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  29.51 
 
 		 380 aa  96.3  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 365 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 389 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.41 
 
 		 378 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  23.48 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  24.11 
 
 		 330 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  28.9 
 
 		 379 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0753  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 384 aa  93.6  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  27.42 
 
 		 440 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  28.18 
 
 		 389 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.23 
 
 		 369 aa  93.6  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  24.23 
 
 		 369 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 382 aa  93.2  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.66 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  29.15 
 
 		 360 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.66 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.49 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.12 
 
 		 369 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  23.94 
 
 		 369 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.68 
 
 		 369 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  23.73 
 
 		 369 aa  90.1  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4274  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 418 aa  90.1  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 382 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  23.51 
 
 		 417 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  23.24 
 
 		 417 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 375 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 365 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  25.89 
 
 		 411 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>