More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4423 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 372 aa  757    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  62.19 
 
 		 371 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  55.28 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  51.77 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  54.31 
 
 		 378 aa  371  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  55.01 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  54.73 
 
 		 378 aa  362  8e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  50.14 
 
 		 383 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  52.75 
 
 		 378 aa  342  5.999999999999999e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  47.55 
 
 		 374 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  47.01 
 
 		 374 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  47.01 
 
 		 374 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  48.42 
 
 		 356 aa  323  3e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  46.29 
 
 		 365 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  46.99 
 
 		 378 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  45.78 
 
 		 369 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  47.59 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  46.02 
 
 		 364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  47.43 
 
 		 376 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  46.83 
 
 		 374 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  45.14 
 
 		 367 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  41.19 
 
 		 375 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  40.05 
 
 		 380 aa  277  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  43.05 
 
 		 375 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  43.37 
 
 		 371 aa  249  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 984 aa  133  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 983 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 390 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  28.23 
 
 		 440 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 389 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.64 
 
 		 417 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  29.72 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  31.72 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  27.82 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.64 
 
 		 417 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  30.99 
 
 		 372 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  28.61 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  29.02 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  25.57 
 
 		 391 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  25.57 
 
 		 391 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  30.65 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  29.18 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  25.32 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  28.26 
 
 		 374 aa  106  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  25.32 
 
 		 391 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  25.32 
 
 		 391 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  25.32 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  26.86 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 960 aa  104  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  29.82 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0928  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 383 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  29.59 
 
 		 401 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  25.44 
 
 		 391 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 385 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  27.3 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3536  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 382 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  29.15 
 
 		 410 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  31.98 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  30.73 
 
 		 398 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 389 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  29.84 
 
 		 389 aa  99.8  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  25.7 
 
 		 373 aa  99.4  8e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 386 aa  99.4  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  29.11 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  31.69 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  27.63 
 
 		 405 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5371  FAD dependent oxidoreductase  27.82 
 
 		 382 aa  98.6  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  27.37 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  29.14 
 
 		 395 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  28.12 
 
 		 371 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  25.33 
 
 		 375 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  27.85 
 
 		 402 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  25.45 
 
 		 384 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  22.22 
 
 		 372 aa  96.3  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  25.64 
 
 		 330 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  31.44 
 
 		 393 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  30.18 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  28.91 
 
 		 371 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  27.67 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  27.67 
 
 		 363 aa  94.4  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  25.62 
 
 		 371 aa  94  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>