More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4400 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 371 aa  749    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4423  FAD dependent oxidoreductase  62.19 
 
 		 372 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2706  putative FAD dependent oxidoreductase  52.7 
 
 		 378 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  50.56 
 
 		 385 aa  358  6e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  50.41 
 
 		 390 aa  354  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1893  FAD dependent oxidoreductase  52.16 
 
 		 378 aa  353  2e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0219464  normal  0.437636 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7053  FAD dependent oxidoreductase  50.86 
 
 		 378 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4416  FAD dependent oxidoreductase  51.37 
 
 		 378 aa  336  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.426575  normal  0.912547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4376  FAD dependent oxidoreductase  45.95 
 
 		 383 aa  334  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  49.18 
 
 		 374 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  48.63 
 
 		 374 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  48.63 
 
 		 374 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8303  D-nopaline dehydrogenase  46.42 
 
 		 356 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.039629  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000037  nopaline dehydrogenase putative  43.71 
 
 		 365 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1839  FAD dependent oxidoreductase  49.46 
 
 		 376 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.672748  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1170  putative FAD dependent oxidoreductase  48.61 
 
 		 367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5994  FAD dependent oxidoreductase  48.49 
 
 		 374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.57246  normal  0.360329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0204  FAD dependent oxidoreductase  45.55 
 
 		 385 aa  300  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.338423  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1833  opine oxidase subunit B  44.41 
 
 		 378 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2709  D-nopaline dehydrogenase  43.06 
 
 		 364 aa  295  7e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.933901  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1933  FAD dependent oxidoreductase  44.54 
 
 		 369 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4457  nopaline dehydrogenase, putative  42.08 
 
 		 375 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000050216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4343  FAD dependent oxidoreductase  42.7 
 
 		 375 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290425  normal  0.660783 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8321  D-nopaline dehydrogenase  41.55 
 
 		 380 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.869573  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4936  FAD dependent oxidoreductase  46.72 
 
 		 371 aa  275  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0618076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  29.87 
 
 		 382 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  26.53 
 
 		 390 aa  111  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.23 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  30.77 
 
 		 389 aa  106  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 389 aa  106  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 393 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  28.53 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 394 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.2 
 
 		 983 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 984 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  26.7 
 
 		 417 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  26.06 
 
 		 383 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  27.63 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  28.69 
 
 		 376 aa  99.8  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  27.55 
 
 		 371 aa  99.4  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  27.51 
 
 		 385 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  28.45 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  24.45 
 
 		 369 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 398 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 960 aa  96.7  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  24.73 
 
 		 369 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2256  D-amino acid dehydrogenase small subunit  28.08 
 
 		 428 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000681381  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 		 388 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 401 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  30.96 
 
 		 379 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.17 
 
 		 373 aa  94  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  24.45 
 
 		 369 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  24.45 
 
 		 369 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 		 386 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  29.87 
 
 		 375 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  24.45 
 
 		 369 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 391 aa  92.8  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  24.45 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 389 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  27.93 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  26.05 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.05 
 
 		 382 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  27.15 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  26.67 
 
 		 374 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 		 378 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  24.45 
 
 		 369 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  24.45 
 
 		 369 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  26.32 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  22.01 
 
 		 372 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  27.76 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  24.93 
 
 		 387 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  27.11 
 
 		 371 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.82 
 
 		 369 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  23.82 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  27.08 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  27.13 
 
 		 374 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  24.1 
 
 		 369 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  29.11 
 
 		 376 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 393 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0688  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.148887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.72 
 
 		 378 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 		 376 aa  86.7  6e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 500 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  27.68 
 
 		 375 aa  86.3  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  23.44 
 
 		 441 aa  86.3  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 500 aa  86.3  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  27.47 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  26.18 
 
 		 395 aa  84.7  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.46 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  26.23 
 
 		 666 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>