More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2071 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  100 
 
 		 372 aa  768    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  34.58 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  34.01 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  34.41 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  34.58 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  34.84 
 
 		 369 aa  203  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  34.01 
 
 		 369 aa  202  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  34.58 
 
 		 369 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  34.58 
 
 		 369 aa  202  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  34.01 
 
 		 369 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  34.56 
 
 		 369 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  34.01 
 
 		 369 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  36.02 
 
 		 377 aa  195  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2483  glycine oxidase ThiO  32.76 
 
 		 385 aa  176  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.168852  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  29.41 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  28.02 
 
 		 374 aa  170  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3234  glycine oxidase ThiO  27.17 
 
 		 372 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 376 aa  160  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  27.45 
 
 		 382 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  27.79 
 
 		 376 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  27.22 
 
 		 378 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  28.53 
 
 		 365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  28.12 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  27.07 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  27.49 
 
 		 440 aa  143  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  27.25 
 
 		 375 aa  142  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 363 aa  142  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  27.03 
 
 		 363 aa  142  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  27.49 
 
 		 411 aa  139  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  26.98 
 
 		 364 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  27.03 
 
 		 417 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  28.74 
 
 		 367 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 378 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  28.32 
 
 		 376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  28.77 
 
 		 368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  23.42 
 
 		 361 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  28.32 
 
 		 376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  25.15 
 
 		 375 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  25.68 
 
 		 363 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  30.82 
 
 		 360 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  26.07 
 
 		 361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 367 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  25.81 
 
 		 404 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  26.22 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.55 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  28.19 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 		 380 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  27.78 
 
 		 652 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 419 aa  123  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  27.45 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  26.61 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  24.86 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  25.21 
 
 		 410 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  27.22 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  27.76 
 
 		 401 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 365 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  27.73 
 
 		 666 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  25.93 
 
 		 365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  27.33 
 
 		 372 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  28.61 
 
 		 1033 aa  117  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 377 aa  116  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  27.43 
 
 		 666 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  26.29 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  27.57 
 
 		 652 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  26.69 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  24.93 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  25.76 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  25.95 
 
 		 385 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  25.33 
 
 		 371 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 360 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  24.87 
 
 		 819 aa  106  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  25.35 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  26.92 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 379 aa  104  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  25.82 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  23.94 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.91 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.92 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  24.06 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  25 
 
 		 473 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0573  FAD dependent oxidoreductase  23.24 
 
 		 390 aa  99.4  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  24.27 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 394 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  27.41 
 
 		 684 aa  97.1  5e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  25.26 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  25.69 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.03 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6003  FAD dependent oxidoreductase  21.86 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  22.79 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  21.36 
 
 		 368 aa  94.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2673  D-amino acid oxidase  25.54 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  25 
 
 		 342 aa  93.2  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 496 aa  92.8  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.03 
 
 		 369 aa  92.8  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  25.2 
 
 		 425 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  24.17 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>