More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34650 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  100 
 
 		 375 aa  733    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  49.86 
 
 		 335 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  45.73 
 
 		 382 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  43.63 
 
 		 404 aa  233  6e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  45.71 
 
 		 372 aa  230  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  44.01 
 
 		 375 aa  229  8e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  44.15 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  44.41 
 
 		 342 aa  227  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  44.29 
 
 		 338 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  44.63 
 
 		 385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  44 
 
 		 391 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0535  glycine oxidase ThiO  42.9 
 
 		 338 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0545  glycine oxidase ThiO  42.9 
 
 		 338 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0557  glycine oxidase ThiO  42.9 
 
 		 338 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.959703  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  41.62 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  40.92 
 
 		 388 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  41.78 
 
 		 405 aa  203  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  43.14 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  44.22 
 
 		 342 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  40.26 
 
 		 440 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  39.49 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  43.79 
 
 		 398 aa  192  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  40.83 
 
 		 393 aa  192  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0094  glycine oxidase ThiO  45.53 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  40.32 
 
 		 411 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  43.49 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  43.48 
 
 		 349 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  39.14 
 
 		 371 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0495  glycine oxidase ThiO  39.89 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  39.78 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  41.18 
 
 		 373 aa  166  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0580  glycine oxidase ThiO  40 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590429  decreased coverage  0.00474558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  40.56 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2502  glycine oxidase ThiO  35 
 
 		 454 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7518  glycine oxidase ThiO  38.17 
 
 		 402 aa  150  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.316675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  32.01 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0750  glycine oxidase ThiO  30.9 
 
 		 365 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  32.1 
 
 		 369 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  32.1 
 
 		 369 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  34.55 
 
 		 368 aa  145  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  31.82 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  31.82 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  36.34 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  31.16 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  31.25 
 
 		 369 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  31.53 
 
 		 369 aa  142  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  31.25 
 
 		 369 aa  142  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  31.53 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  36.74 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01740  glycine oxidase ThiO  35.28 
 
 		 388 aa  140  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  34.33 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1456  glycine oxidase ThiO  41.48 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.307588  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  26.84 
 
 		 340 aa  136  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  26.84 
 
 		 340 aa  136  7.000000000000001e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  32.13 
 
 		 652 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2781  glycine oxidase ThiO  34.95 
 
 		 450 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207412  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  32.66 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  32.94 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  30.68 
 
 		 330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  33.33 
 
 		 666 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  29.06 
 
 		 369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1456  ATP-dependent DNA helicase RecQ  27.76 
 
 		 394 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28291  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  34.93 
 
 		 371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  32.62 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  31.01 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  29.92 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  29.6 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  35.51 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4149  glycine oxidase ThiO  33.05 
 
 		 666 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.572473 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.81 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.89 
 
 		 367 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  32.6 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  29.25 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  30.62 
 
 		 363 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 363 aa  121  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  30.67 
 
 		 371 aa  120  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07960  glycine oxidase ThiO  35.86 
 
 		 389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0404626  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 354 aa  119  7.999999999999999e-26  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  33.04 
 
 		 316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  28.31 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00481  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  27.38 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.254103  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  37.29 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  37.29 
 
 		 376 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 325 aa  116  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2498  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  33.71 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.373577  normal  0.49294 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0048  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.15 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00501  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.46 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  31.82 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4797  glycine oxidase ThiO  30.67 
 
 		 684 aa  114  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.937607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  31.55 
 
 		 334 aa  112  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  31.64 
 
 		 334 aa  113  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  30.53 
 
 		 363 aa  112  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  25.35 
 
 		 372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  32.15 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  33.72 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>