More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1159 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 428 aa  858    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  44.9 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  40.24 
 
 		 446 aa  273  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 		 446 aa  259  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  41.06 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  41.06 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  41.06 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  41.06 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  38.83 
 
 		 446 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  41.06 
 
 		 442 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  41.06 
 
 		 442 aa  252  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  41.06 
 
 		 442 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  39.71 
 
 		 436 aa  249  6e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  38.41 
 
 		 444 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  38.77 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  38.77 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  38.59 
 
 		 444 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  37.71 
 
 		 444 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  38.26 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 		 442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 		 442 aa  206  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  32.72 
 
 		 447 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 		 443 aa  197  3e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 447 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 439 aa  196  6e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  30.55 
 
 		 441 aa  193  4e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 445 aa  193  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 466 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  31.76 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 442 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 		 447 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  32.27 
 
 		 441 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  32.44 
 
 		 441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 		 451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 441 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 446 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  31.97 
 
 		 441 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  31.57 
 
 		 460 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 		 441 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 		 441 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  31.26 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  32.99 
 
 		 443 aa  176  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 441 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 430 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 433 aa  170  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  29.4 
 
 		 445 aa  170  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  31.09 
 
 		 430 aa  169  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 441 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 443 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 		 430 aa  166  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 		 431 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  30.42 
 
 		 430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  30.9 
 
 		 441 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 441 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  28.85 
 
 		 387 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  25.3 
 
 		 390 aa  136  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2740  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 		 401 aa  136  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0112073  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 		 378 aa  132  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 383 aa  131  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  29.02 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1830  SoxB protein  27.78 
 
 		 377 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.01775  normal  0.260331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.67 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  29.62 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  28.78 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 388 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4345  FAD dependent oxidoreductase  29.64 
 
 		 376 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.957412 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  30.36 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 		 377 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0935  FAD dependent oxidoreductase  28.47 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.311284  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6585  FAD dependent oxidoreductase  28.25 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1388  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 492 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  27.36 
 
 		 385 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 373 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2330  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 394 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00484515  normal  0.869499 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.15 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  25.49 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  26.53 
 
 		 384 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.63 
 
 		 500 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 496 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>