More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2637 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  72.79 
 
 		 441 aa  638    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  73.92 
 
 		 441 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 441 aa  895    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  75.06 
 
 		 441 aa  649    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  68.93 
 
 		 441 aa  624  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  70.52 
 
 		 466 aa  615  1e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  70.75 
 
 		 441 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  70.52 
 
 		 441 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  70.75 
 
 		 441 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  70.29 
 
 		 441 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  70.52 
 
 		 441 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  64.4 
 
 		 441 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  66.67 
 
 		 439 aa  608  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  68.48 
 
 		 441 aa  598  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  69.16 
 
 		 441 aa  594  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  67.42 
 
 		 442 aa  586  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  65.84 
 
 		 445 aa  584  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  68.25 
 
 		 441 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  58.73 
 
 		 441 aa  541  9.999999999999999e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  50.47 
 
 		 441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  45.24 
 
 		 460 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  45.61 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  45.24 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  44.78 
 
 		 442 aa  364  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  44.26 
 
 		 442 aa  356  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  44.34 
 
 		 443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  38.5 
 
 		 442 aa  312  6.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  38.52 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  41.3 
 
 		 446 aa  295  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  39.91 
 
 		 443 aa  293  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  38.8 
 
 		 433 aa  292  8e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  39.91 
 
 		 444 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  38.8 
 
 		 447 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  38.55 
 
 		 447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 451 aa  280  3e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 		 431 aa  262  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  38.41 
 
 		 447 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  36.18 
 
 		 430 aa  256  5e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  37.9 
 
 		 430 aa  256  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  36.87 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 		 431 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  37.1 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  34.17 
 
 		 446 aa  219  7e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  33.11 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  33.11 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  33.11 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 444 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  33.11 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 		 446 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 444 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  33.78 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  33.02 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 455 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4693  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 423 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2644  FAD dependent oxidoreductase  29.86 
 
 		 396 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.875281  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  27.83 
 
 		 386 aa  146  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 385 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6084  FAD dependent oxidoreductase  29.66 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.793169 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3400  FAD dependent oxidoreductase  28.88 
 
 		 394 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0126015  normal  0.687523 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0151  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 389 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0781  putative FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.740851 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4733  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 383 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.233714  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3630  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 383 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0255  oxidoreductase, FAD-binding protein  27.75 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 		 390 aa  126  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 816 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3036  FAD dependent oxidoreductase  26.93 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  25.58 
 
 		 381 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4426  FAD dependent oxidoreductase  26.71 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.767277 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 		 383 aa  124  4e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4373  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 385 aa  122  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.14 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 377 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  26.78 
 
 		 816 aa  120  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2939  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 378 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  26.67 
 
 		 361 aa  119  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 382 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2281  FAD dependent oxidoreductase  27.62 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405661  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  27.61 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6006  FAD dependent oxidoreductase  26.48 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  28.95 
 
 		 378 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  25.19 
 
 		 376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0048  FAD dependent oxidoreductase  25.25 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 496 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6497  oxidoreductase  27.32 
 
 		 380 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  33.61 
 
 		 500 aa  114  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 		 500 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1254  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 		 799 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0777915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  26.67 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>