More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0860 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0860  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 471 aa  962    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6338  FAD dependent oxidoreductase  35.76 
 
 		 446 aa  232  9e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3761  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 		 431 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1592  FAD dependent oxidoreductase  35.12 
 
 		 430 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  30.54 
 
 		 460 aa  213  3.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3166  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 430 aa  209  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.71572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0459  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 430 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3518  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 431 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00768036  normal  0.224647 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4605  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 444 aa  206  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4956  FAD dependent oxidoreductase  30.59 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579279  normal  0.246978 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5297  oxidoreductase  32.56 
 
 		 443 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.893259  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2277  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.811789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1838  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 430 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.659002  normal  0.295676 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2825  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 		 443 aa  192  8e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.893963 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5298  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 441 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.494862  normal  0.217732 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0765  putative FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 442 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.144956 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0702  D-amino acid oxidase family protein  31.95 
 
 		 442 aa  189  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.382621  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  28.54 
 
 		 441 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2645  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  31.47 
 
 		 445 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  29.07 
 
 		 442 aa  180  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1548  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 441 aa  179  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.746039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1649  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 441 aa  179  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.756737  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3826  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 442 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2919  FAD dependent oxidoreductase  30.91 
 
 		 442 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6361  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6270  FAD dependent oxidoreductase  30.41 
 
 		 441 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119616 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6064  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 441 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6437  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6672  FAD dependent oxidoreductase  30.18 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1879  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 447 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2806  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 466 aa  167  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827549  normal  0.954723 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0236  AgaE protein  29.84 
 
 		 447 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5589  FAD dependent oxidoreductase  29.56 
 
 		 441 aa  166  9e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.17966 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5300  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 441 aa  166  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.158205 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1927  putative deaminase  30 
 
 		 441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.70122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5001  FAD dependent oxidoreductase  29.98 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.58394  normal  0.404419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5907  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.579318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1578  FAD dependent oxidoreductase  30.23 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.497346  normal  0.349993 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3069  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.211431  hitchhiker  0.00906466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2637  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 441 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.754665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3290  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 451 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3346  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00864738 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3695  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 445 aa  154  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.822265  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1769  hypothetical protein  29.25 
 
 		 446 aa  153  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000748216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  29.79 
 
 		 446 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5640  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.738738  normal  0.548415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3709  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.611519  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4659  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1284  FAD-dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 442 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1294  hypothetical protein  26.89 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0272  hypothetical protein  26.89 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0655938  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0543  hypothetical protein  26.89 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1362  FAD-dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1023  FAD-dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 442 aa  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2539  agaE protein  26.89 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154835  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4505  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 444 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4047  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 455 aa  137  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345279  normal  0.812767 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1161  FAD dependent oxidoreductase  27.29 
 
 		 444 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1461  putative lipoprotein  26.89 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.15 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  25.46 
 
 		 361 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  22.88 
 
 		 390 aa  99  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  22.41 
 
 		 382 aa  93.6  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  24.88 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2072  FAD dependent oxidoreductase  22.88 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  23.21 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  23.56 
 
 		 983 aa  88.2  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  23.43 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  22.81 
 
 		 984 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4803  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355272  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 444 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  28.33 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  23.47 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  22.92 
 
 		 385 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  22.65 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 		 816 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  24.64 
 
 		 363 aa  80.5  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1159  putative FAD dependent oxidoreductase  23.29 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1890  FAD dependent oxidoreductase  22.64 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125592  normal  0.229246 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  22.41 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  22.51 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  22.17 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  24.24 
 
 		 375 aa  79.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.12 
 
 		 857 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  27.83 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  22.17 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 425 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4894  FAD dependent oxidoreductase  21.67 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  23.58 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 816 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1296  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 		 401 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.43026  normal  0.445947 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  22.17 
 
 		 369 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2709  hypothetical protein  22.17 
 
 		 390 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.9016 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  27.38 
 
 		 500 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  22.18 
 
 		 440 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5264  FAD dependent oxidoreductase  27.17 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.363597 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6294  FAD dependent oxidoreductase  22.88 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>