More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6675 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 444 aa  905    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  97.18 
 
 		 425 aa  844    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  99.77 
 
 		 444 aa  904    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  95.05 
 
 		 444 aa  860    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  98.35 
 
 		 425 aa  853    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  69.88 
 
 		 425 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  63.29 
 
 		 425 aa  587  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  66.12 
 
 		 424 aa  566  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  65.27 
 
 		 431 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  66.35 
 
 		 424 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  65.18 
 
 		 424 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  64.71 
 
 		 424 aa  551  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  58.74 
 
 		 429 aa  498  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  56.24 
 
 		 425 aa  488  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  56.74 
 
 		 425 aa  485  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  56.87 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  57.14 
 
 		 429 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  53.66 
 
 		 424 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  55.08 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  53.41 
 
 		 424 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  54.82 
 
 		 425 aa  465  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  55.79 
 
 		 424 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  56.28 
 
 		 430 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  54.85 
 
 		 424 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  56.71 
 
 		 441 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  56.24 
 
 		 441 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  47.76 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  40.76 
 
 		 427 aa  315  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  35.44 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  37.75 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  36.89 
 
 		 430 aa  223  7e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  31.11 
 
 		 428 aa  222  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  35.4 
 
 		 430 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  36.65 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  36.65 
 
 		 430 aa  221  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  36.41 
 
 		 430 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 435 aa  220  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  35.4 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  33.84 
 
 		 437 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 435 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  34.72 
 
 		 439 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 		 435 aa  216  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 435 aa  216  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  33.7 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  34.47 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  30.94 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  32.02 
 
 		 425 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  37.19 
 
 		 443 aa  210  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  29.91 
 
 		 435 aa  210  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 436 aa  209  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  34.7 
 
 		 431 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  34.45 
 
 		 429 aa  209  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 431 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 		 434 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 437 aa  206  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  34.25 
 
 		 436 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0567  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 431 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 429 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 		 439 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 		 430 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 		 428 aa  203  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  36.54 
 
 		 468 aa  203  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 431 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 435 aa  202  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  36.79 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  36.3 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 		 429 aa  200  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  35.83 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 		 437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 430 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 435 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  31.95 
 
 		 435 aa  199  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  34.6 
 
 		 429 aa  199  9e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 		 449 aa  199  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 		 434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  34.69 
 
 		 434 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 		 433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  36.07 
 
 		 440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  34.95 
 
 		 433 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  34.85 
 
 		 434 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  35.62 
 
 		 433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  34.71 
 
 		 433 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  29.57 
 
 		 435 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 		 440 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6342  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 441 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  33.51 
 
 		 429 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  31.86 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>