More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4658 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  71.79 
 
 		 468 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 449 aa  913    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  75.46 
 
 		 434 aa  693    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  74.31 
 
 		 434 aa  680    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  71.79 
 
 		 468 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  74.31 
 
 		 434 aa  682    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  91.31 
 
 		 440 aa  832    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  71.99 
 
 		 433 aa  650    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  71.79 
 
 		 468 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  74.31 
 
 		 434 aa  682    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  73.38 
 
 		 434 aa  676    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  72.77 
 
 		 439 aa  672    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  72.79 
 
 		 443 aa  618  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  53.78 
 
 		 437 aa  437  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  48.35 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  48.46 
 
 		 430 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  49.17 
 
 		 430 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  48.76 
 
 		 449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  48.82 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  49.07 
 
 		 433 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  47.75 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  47.75 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  47.75 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  47.52 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  45.39 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  48.58 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  48.34 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  48.34 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  48.34 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  48.34 
 
 		 433 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  47.6 
 
 		 425 aa  370  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  47.62 
 
 		 433 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  47.38 
 
 		 433 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  45.27 
 
 		 437 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  45.31 
 
 		 436 aa  352  8e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  45.14 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  43.88 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  40.43 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 		 435 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  40.57 
 
 		 435 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 		 435 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  44.34 
 
 		 439 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  43.51 
 
 		 429 aa  340  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  40.9 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  43.51 
 
 		 430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  44.13 
 
 		 439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 		 435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  40.33 
 
 		 435 aa  335  9e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  42.08 
 
 		 427 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  43.41 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  39.86 
 
 		 435 aa  333  4e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  40.33 
 
 		 435 aa  333  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  39.1 
 
 		 435 aa  332  6e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  40.67 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 		 434 aa  331  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  42.99 
 
 		 437 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  43.56 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  46.57 
 
 		 419 aa  326  5e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 		 427 aa  326  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  41.81 
 
 		 427 aa  325  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  40.66 
 
 		 427 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00465  oxidoreductase  45.08 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.835263  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  42.23 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  38.15 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  39.07 
 
 		 440 aa  323  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  41.25 
 
 		 427 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 435 aa  322  6e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  41.58 
 
 		 427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  40.53 
 
 		 427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  41.23 
 
 		 428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  43.41 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 		 426 aa  320  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.19 
 
 		 426 aa  320  3e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.19 
 
 		 426 aa  320  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  40.19 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.19 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  41.15 
 
 		 428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  40.19 
 
 		 426 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  42.65 
 
 		 429 aa  319  6e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  41.15 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  42.93 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.19 
 
 		 426 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  40.75 
 
 		 431 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  41.59 
 
 		 428 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  41.59 
 
 		 428 aa  317  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  39.95 
 
 		 426 aa  317  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  41.59 
 
 		 428 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  39.72 
 
 		 427 aa  316  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  40.75 
 
 		 431 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 		 431 aa  315  8e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 		 428 aa  315  8e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  41 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>