More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3048 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  97.04 
 
 		 434 aa  843    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  78.82 
 
 		 468 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  78.82 
 
 		 468 aa  682    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  92.03 
 
 		 434 aa  810    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  92.71 
 
 		 434 aa  815    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  80.41 
 
 		 443 aa  679    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  78.82 
 
 		 468 aa  684    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  74.48 
 
 		 440 aa  670    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  87.93 
 
 		 433 aa  765    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  72.77 
 
 		 449 aa  672    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  92.03 
 
 		 434 aa  810    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  91.57 
 
 		 434 aa  807    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 439 aa  875    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  50.68 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  50 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  48.01 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  49.53 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  48.24 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  49.06 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  49.53 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  47.02 
 
 		 449 aa  386  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  50.23 
 
 		 437 aa  383  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  48.12 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  46.98 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  45.75 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  45.68 
 
 		 441 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  48.01 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  49.63 
 
 		 430 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  47.54 
 
 		 433 aa  360  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  47.54 
 
 		 433 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  47.07 
 
 		 433 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  47.75 
 
 		 433 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  47.28 
 
 		 433 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  46.1 
 
 		 425 aa  350  3e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  42.73 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  42.39 
 
 		 437 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  44.63 
 
 		 438 aa  323  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  42.02 
 
 		 439 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  39.71 
 
 		 435 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  41.45 
 
 		 436 aa  319  5e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  42.54 
 
 		 429 aa  319  7e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  42.13 
 
 		 430 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  38.79 
 
 		 435 aa  318  9e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  39.46 
 
 		 435 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  41.55 
 
 		 439 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  39.46 
 
 		 435 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  39.46 
 
 		 435 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  39.72 
 
 		 435 aa  316  5e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  41.3 
 
 		 437 aa  315  9e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  40.43 
 
 		 427 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  39.61 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  40.19 
 
 		 427 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  41.31 
 
 		 431 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  38 
 
 		 425 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  38.97 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  39.22 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  39.22 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  39.49 
 
 		 427 aa  310  5e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  41.87 
 
 		 430 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 		 431 aa  308  9e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00465  oxidoreductase  46.04 
 
 		 438 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.835263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 		 435 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  39.39 
 
 		 427 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  43.85 
 
 		 419 aa  306  6e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  38.32 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  38.32 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  38.73 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  37.25 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 		 427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  43.07 
 
 		 433 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 		 427 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  38.12 
 
 		 440 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  41.03 
 
 		 431 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  39.85 
 
 		 427 aa  302  9e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 		 431 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  42.23 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  42.72 
 
 		 429 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06960  hypothetical protein  42.22 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  45.23 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  39.95 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  38.35 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  42.3 
 
 		 430 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 427 aa  292  7e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  42.57 
 
 		 433 aa  292  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  42.05 
 
 		 430 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  42.57 
 
 		 433 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  38.06 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  38.06 
 
 		 426 aa  291  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  38.06 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  38.06 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  38.06 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  38.06 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  38.06 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  38.06 
 
 		 426 aa  290  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  37.65 
 
 		 428 aa  290  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  38.53 
 
 		 428 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>