More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3001 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  80.65 
 
 
468 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  80.65 
 
 
468 aa  693    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  74.31 
 
 
449 aa  682    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  93.09 
 
 
434 aa  814    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  81.34 
 
 
443 aa  677    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
434 aa  864    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  80.65 
 
 
468 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  75.69 
 
 
440 aa  679    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  93.09 
 
 
434 aa  815    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
434 aa  864    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  97.93 
 
 
434 aa  849    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  88.71 
 
 
433 aa  765    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  92.03 
 
 
439 aa  810    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  51.03 
 
 
437 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  48.66 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  48.1 
 
 
430 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  48.93 
 
 
430 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  50.59 
 
 
437 aa  391  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  47.74 
 
 
430 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  47.36 
 
 
441 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  49.17 
 
 
430 aa  383  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  47.42 
 
 
435 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  48.46 
 
 
430 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  48.46 
 
 
430 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  48.46 
 
 
430 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  47.42 
 
 
433 aa  375  1e-103  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  49.05 
 
 
430 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  47.63 
 
 
433 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  47.75 
 
 
433 aa  356  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  47.75 
 
 
433 aa  356  5e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  47.28 
 
 
433 aa  353  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  47.97 
 
 
433 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  47.73 
 
 
433 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  45.93 
 
 
425 aa  348  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  45.86 
 
 
438 aa  336  5.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  42.76 
 
 
437 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 
437 aa  333  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  39.72 
 
 
435 aa  332  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 
435 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 
435 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 
436 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 
435 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 
435 aa  326  5e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  38.77 
 
 
435 aa  326  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  40.43 
 
 
435 aa  325  9e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  42.62 
 
 
430 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  42.08 
 
 
437 aa  323  5e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
425 aa  322  6e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  39.57 
 
 
435 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  39.72 
 
 
435 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  38.53 
 
 
434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00465  oxidoreductase  46.06 
 
 
438 aa  320  5e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.835263  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 
435 aa  319  7e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  41.15 
 
 
427 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 
429 aa  318  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  38.77 
 
 
435 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  40.91 
 
 
427 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  42.17 
 
 
430 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  41.61 
 
 
439 aa  316  7e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 
440 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  38.15 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  41.84 
 
 
439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  39.01 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  43.43 
 
 
429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  40.1 
 
 
427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  39.48 
 
 
427 aa  312  5.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  44.5 
 
 
419 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06960  hypothetical protein  42.76 
 
 
429 aa  312  9e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 
427 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  39.48 
 
 
427 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  42.99 
 
 
429 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 
427 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  40.86 
 
 
431 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  39.48 
 
 
427 aa  308  9e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  36.73 
 
 
435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  43.2 
 
 
441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  40.38 
 
 
431 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 
431 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 
427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 
427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  41.55 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 
429 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  43.2 
 
 
429 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  43.2 
 
 
429 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  43.2 
 
 
429 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 
431 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  41.19 
 
 
423 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 
428 aa  300  4e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  41.69 
 
 
430 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0802  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 
429 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  39.05 
 
 
428 aa  298  1e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  39.71 
 
 
428 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  39.71 
 
 
428 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 
428 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  44.42 
 
 
424 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  38.76 
 
 
426 aa  297  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 
428 aa  297  2e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  38.76 
 
 
426 aa  297  2e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  38.76 
 
 
426 aa  296  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 
428 aa  297  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>