More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4808 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3719  FAD dependent oxidoreductase  87.88 
 
 		 429 aa  750    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.0527853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0802  FAD dependent oxidoreductase  93.94 
 
 		 429 aa  808    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 429 aa  852    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  91.38 
 
 		 429 aa  781    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  91.84 
 
 		 429 aa  786    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  91.84 
 
 		 429 aa  786    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  96.27 
 
 		 441 aa  824    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1847  FAD dependent oxidoreductase  74.13 
 
 		 429 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.948299  hitchhiker  0.00800428 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3625  FAD dependent oxidoreductase  73.19 
 
 		 429 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.301202  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4020  FAD dependent oxidoreductase  72.96 
 
 		 429 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.471109  normal  0.716709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1813  FAD dependent oxidoreductase  72.73 
 
 		 429 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00738573  normal  0.652895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06960  hypothetical protein  68.62 
 
 		 429 aa  597  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  68.62 
 
 		 429 aa  589  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  66.51 
 
 		 429 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  45.13 
 
 		 430 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  45.84 
 
 		 430 aa  362  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  44.92 
 
 		 430 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  45.37 
 
 		 430 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  45.37 
 
 		 430 aa  356  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  45.37 
 
 		 430 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  45.84 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  45.37 
 
 		 433 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  44.89 
 
 		 433 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  44.92 
 
 		 433 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  44.42 
 
 		 433 aa  339  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  45.15 
 
 		 433 aa  339  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  40.71 
 
 		 426 aa  322  6e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  40.43 
 
 		 426 aa  316  5e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 		 426 aa  316  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  40.43 
 
 		 426 aa  316  5e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.43 
 
 		 426 aa  316  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.43 
 
 		 426 aa  316  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.43 
 
 		 426 aa  315  8e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 		 426 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.19 
 
 		 426 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  42.69 
 
 		 449 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  39.95 
 
 		 426 aa  311  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  42.23 
 
 		 437 aa  309  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  42.69 
 
 		 440 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  43.2 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  43.2 
 
 		 434 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 		 434 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  41.49 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  41.72 
 
 		 431 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  41.72 
 
 		 431 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  36.56 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  44.86 
 
 		 438 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  39 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  40.98 
 
 		 437 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  42.23 
 
 		 436 aa  299  5e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  44.68 
 
 		 437 aa  299  6e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  41.69 
 
 		 431 aa  298  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  40.97 
 
 		 437 aa  297  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  36.97 
 
 		 428 aa  297  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  43.2 
 
 		 433 aa  296  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 427 aa  296  6e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  36.88 
 
 		 428 aa  296  6e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  38 
 
 		 427 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 433 aa  296  7e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  36.88 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  36.88 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  37.77 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 430 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  40.81 
 
 		 423 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  36.88 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 		 428 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  36.88 
 
 		 428 aa  293  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  39.95 
 
 		 449 aa  293  5e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  35.93 
 
 		 428 aa  293  6e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  36.88 
 
 		 428 aa  292  6e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  42.03 
 
 		 439 aa  292  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  39.53 
 
 		 435 aa  292  9e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 		 428 aa  292  9e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  41.53 
 
 		 434 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  42.14 
 
 		 425 aa  291  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  42.49 
 
 		 439 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  39.76 
 
 		 427 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  37.05 
 
 		 428 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  38.33 
 
 		 427 aa  289  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 427 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  36.6 
 
 		 427 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  42.76 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 427 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 427 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 		 435 aa  288  2e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  36.41 
 
 		 428 aa  286  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  42.52 
 
 		 468 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  39.3 
 
 		 435 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 		 435 aa  286  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 434 aa  285  7e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  42.52 
 
 		 468 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 		 435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  37.14 
 
 		 427 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  39.63 
 
 		 433 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  43.69 
 
 		 443 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>