More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4659 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
430 aa  885    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  77.91 
 
 
430 aa  697    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  77.34 
 
 
433 aa  674    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  77.91 
 
 
430 aa  698    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  77.1 
 
 
433 aa  673    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  77.67 
 
 
430 aa  696    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  77.1 
 
 
433 aa  673    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  95.12 
 
 
430 aa  854    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  77.21 
 
 
433 aa  675    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  76.64 
 
 
433 aa  672    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  77.67 
 
 
430 aa  695    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  77.44 
 
 
433 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  66.51 
 
 
430 aa  597  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  66.74 
 
 
430 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  51.89 
 
 
435 aa  451  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  50.8 
 
 
449 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  51.28 
 
 
441 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  51.28 
 
 
436 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  53.16 
 
 
437 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  50.23 
 
 
437 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  48.85 
 
 
437 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  49.17 
 
 
449 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  48.93 
 
 
440 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  49.52 
 
 
433 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  50.47 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  49.17 
 
 
434 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  50.12 
 
 
438 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  48.95 
 
 
437 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  50.24 
 
 
439 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  48.85 
 
 
437 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  48.22 
 
 
434 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  48.22 
 
 
468 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  49.29 
 
 
434 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  49.88 
 
 
443 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  48.46 
 
 
468 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  49.76 
 
 
423 aa  392  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  48.22 
 
 
468 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  47.47 
 
 
433 aa  395  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  46.82 
 
 
428 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  47.09 
 
 
431 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  49.88 
 
 
430 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 
428 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  47.74 
 
 
434 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 
428 aa  388  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  46.9 
 
 
428 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  46.85 
 
 
431 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  46.59 
 
 
428 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  47.74 
 
 
434 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  46.59 
 
 
428 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  48.24 
 
 
439 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  45.75 
 
 
435 aa  385  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 
428 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  50.37 
 
 
430 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  47.45 
 
 
431 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  46.62 
 
 
431 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  46.12 
 
 
428 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  46.01 
 
 
428 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  45.61 
 
 
440 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  46.12 
 
 
428 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 
435 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  45.18 
 
 
428 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  44.94 
 
 
428 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  45.54 
 
 
428 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  44.96 
 
 
435 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  44.68 
 
 
435 aa  375  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  44.68 
 
 
435 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  45.56 
 
 
429 aa  375  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  44.26 
 
 
435 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  49.39 
 
 
430 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  43.13 
 
 
435 aa  369  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  45.35 
 
 
425 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  49.64 
 
 
430 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  44.5 
 
 
435 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  43.6 
 
 
434 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  44.5 
 
 
435 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  44.5 
 
 
435 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  47.62 
 
 
424 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  41.43 
 
 
425 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  43.74 
 
 
435 aa  365  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  43.95 
 
 
433 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  43.74 
 
 
435 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 
426 aa  363  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  43.26 
 
 
435 aa  363  3e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  46.28 
 
 
433 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  44.84 
 
 
427 aa  362  8e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  45.32 
 
 
433 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 
428 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  45.39 
 
 
441 aa  360  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  44.42 
 
 
426 aa  359  5e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  44.42 
 
 
426 aa  359  6e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  44.42 
 
 
426 aa  359  6e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  46.65 
 
 
427 aa  359  6e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  43.33 
 
 
435 aa  359  7e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  45.08 
 
 
433 aa  358  8e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  44.18 
 
 
426 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  44.18 
 
 
426 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  44.18 
 
 
426 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  44.18 
 
 
426 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  44.84 
 
 
427 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  44.1 
 
 
427 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>