More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6070 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  90.23 
 
 		 430 aa  794    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 430 aa  870    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  66.28 
 
 		 430 aa  596  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  66.74 
 
 		 430 aa  594  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  66.74 
 
 		 430 aa  578  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  66.51 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  66.51 
 
 		 430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  66.51 
 
 		 430 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  67.06 
 
 		 433 aa  569  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  66.59 
 
 		 433 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  66.51 
 
 		 433 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  66.36 
 
 		 433 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  66.28 
 
 		 433 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  65.42 
 
 		 433 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  49.89 
 
 		 435 aa  433  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  52.46 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  50 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  49.3 
 
 		 437 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  50.12 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  51.29 
 
 		 439 aa  408  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 436 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  50.58 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  51.17 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  49.53 
 
 		 440 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  48.66 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  50.58 
 
 		 431 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  48.58 
 
 		 449 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  49.88 
 
 		 431 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  48.95 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  49.65 
 
 		 431 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 		 435 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  45.92 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  45.92 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 		 435 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  44.84 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  49.77 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  45.26 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  45.22 
 
 		 435 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  49.29 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  48.6 
 
 		 433 aa  385  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  49.41 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  50.95 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  45.48 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  44.88 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  49.17 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  49.05 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  45.81 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  49.05 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  49.17 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  45.71 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  45.71 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  49.05 
 
 		 468 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  49.05 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  45.71 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  46.54 
 
 		 437 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  45.71 
 
 		 428 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  46.19 
 
 		 428 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  49.05 
 
 		 468 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  44.29 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  43.93 
 
 		 435 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  49.63 
 
 		 439 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  49.15 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  49.42 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  45.48 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  44.52 
 
 		 434 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  45.71 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  45.71 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  45.71 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  43.59 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  48.33 
 
 		 429 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  44.87 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  49.41 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  48.33 
 
 		 423 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  44.76 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  43.68 
 
 		 428 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  45 
 
 		 428 aa  365  1e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  47.62 
 
 		 427 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  44.81 
 
 		 426 aa  363  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  44.81 
 
 		 426 aa  363  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  44.81 
 
 		 426 aa  363  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  44.58 
 
 		 426 aa  363  3e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  44.58 
 
 		 426 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  44.58 
 
 		 426 aa  363  4e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  47.26 
 
 		 425 aa  363  4e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  44.58 
 
 		 426 aa  363  4e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  44.58 
 
 		 426 aa  363  4e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  44.95 
 
 		 427 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  44.08 
 
 		 427 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  42.38 
 
 		 440 aa  362  7.0000000000000005e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  44.81 
 
 		 426 aa  362  8e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  44.84 
 
 		 427 aa  362  9e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  44.08 
 
 		 426 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  45.11 
 
 		 427 aa  361  1e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  44.08 
 
 		 427 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 		 427 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 		 427 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  48.12 
 
 		 430 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  48.48 
 
 		 430 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  44.23 
 
 		 427 aa  358  9e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 		 433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>