More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3518 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
425 aa  882    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  47.39 
 
 
423 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  46.56 
 
 
433 aa  391  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  46.32 
 
 
433 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  47.85 
 
 
436 aa  382  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  45.22 
 
 
433 aa  378  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  47.75 
 
 
439 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  42.08 
 
 
430 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  41.94 
 
 
430 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  41.43 
 
 
430 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  44.86 
 
 
436 aa  364  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  40.52 
 
 
430 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  40.52 
 
 
430 aa  362  8e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  40.52 
 
 
430 aa  362  9e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  41 
 
 
430 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  42.55 
 
 
437 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  43.12 
 
 
428 aa  354  1e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  42.08 
 
 
437 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 
433 aa  348  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 
433 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 
433 aa  345  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
433 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  41.41 
 
 
439 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 
433 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  41.65 
 
 
439 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 
436 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  40.71 
 
 
437 aa  340  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  40.76 
 
 
430 aa  338  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  40.86 
 
 
427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 
433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  40.57 
 
 
427 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 
440 aa  333  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  40.67 
 
 
440 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  39.72 
 
 
428 aa  333  5e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  40.57 
 
 
438 aa  332  6e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  39.43 
 
 
428 aa  332  9e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  40.67 
 
 
449 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  39.43 
 
 
428 aa  332  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  39.9 
 
 
434 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  39.43 
 
 
428 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  38.95 
 
 
428 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 
427 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  39.19 
 
 
428 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  39.19 
 
 
428 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 
427 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 
427 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 
427 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  40.05 
 
 
431 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  38.95 
 
 
428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  39.57 
 
 
427 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  39.67 
 
 
428 aa  326  5e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  39.1 
 
 
427 aa  326  5e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  39.63 
 
 
431 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 
428 aa  325  7e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
434 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 
428 aa  324  2e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  39.72 
 
 
428 aa  323  4e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 
428 aa  323  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  40.25 
 
 
427 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
434 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
434 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  38.68 
 
 
427 aa  322  8e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  39.67 
 
 
426 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  39.67 
 
 
426 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  39.67 
 
 
426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  39.67 
 
 
426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  39.29 
 
 
435 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  39.67 
 
 
426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  39.44 
 
 
433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  39.67 
 
 
426 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  39.58 
 
 
431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  39.67 
 
 
426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  39.67 
 
 
426 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  39.67 
 
 
426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  39.18 
 
 
434 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
433 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  39.14 
 
 
468 aa  320  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  38.8 
 
 
433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  39.9 
 
 
434 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  39.68 
 
 
431 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  39.38 
 
 
427 aa  319  7e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  37.77 
 
 
428 aa  318  1e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  38.9 
 
 
468 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
429 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 
421 aa  317  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  42.08 
 
 
437 aa  317  3e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  38.9 
 
 
468 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  38.86 
 
 
427 aa  316  5e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  39.34 
 
 
429 aa  315  9e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  39.34 
 
 
435 aa  315  9e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  38.21 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  39.1 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  40.79 
 
 
437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  38.26 
 
 
435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 
435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  39.1 
 
 
435 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 
426 aa  312  7.999999999999999e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  38.42 
 
 
434 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  39.1 
 
 
435 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>