More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3049 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  94.69 
 
 		 433 aa  814    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  76.51 
 
 		 430 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  93.07 
 
 		 433 aa  804    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  90.53 
 
 		 433 aa  787    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  78.14 
 
 		 430 aa  701    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  76.51 
 
 		 430 aa  686    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  94.46 
 
 		 433 aa  810    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  77.67 
 
 		 430 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  77.44 
 
 		 430 aa  699    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  96.77 
 
 		 433 aa  835    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  76.74 
 
 		 430 aa  689    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 433 aa  885    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  66.05 
 
 		 430 aa  587  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  66.28 
 
 		 430 aa  564  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  53.41 
 
 		 435 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  51.03 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  51.28 
 
 		 441 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  49.77 
 
 		 439 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  53.04 
 
 		 437 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  48.86 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  48.1 
 
 		 437 aa  392  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  47.61 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  47.63 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  47.73 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  47.21 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  47.06 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  47.06 
 
 		 428 aa  385  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  47.06 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  47.32 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  48.81 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  48.26 
 
 		 433 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  47.32 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  46.35 
 
 		 428 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  44.08 
 
 		 440 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  47.62 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  47.66 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  45.75 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  45.75 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  46.62 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  45.65 
 
 		 428 aa  375  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  45.75 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  47.89 
 
 		 438 aa  375  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  47.55 
 
 		 437 aa  371  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  48.33 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  45.52 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  45.18 
 
 		 428 aa  369  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  47.97 
 
 		 434 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  46.53 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  46.21 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  47.97 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  47.74 
 
 		 443 aa  368  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  46.45 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  47.27 
 
 		 468 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  47.9 
 
 		 430 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  44.76 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  44.26 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  47.28 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  47.02 
 
 		 425 aa  368  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  42.76 
 
 		 435 aa  363  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  47.3 
 
 		 430 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  44.47 
 
 		 427 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  47.03 
 
 		 468 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  44.99 
 
 		 433 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  47.03 
 
 		 468 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  47.73 
 
 		 434 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  47.73 
 
 		 434 aa  362  9e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  47.99 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  43.76 
 
 		 428 aa  360  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  44.24 
 
 		 427 aa  358  9e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  44.16 
 
 		 427 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  48.77 
 
 		 430 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  44.16 
 
 		 427 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  48.1 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  44 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  43.22 
 
 		 427 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  48.53 
 
 		 430 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00465  oxidoreductase  50.35 
 
 		 438 aa  355  8.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.835263  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  42.99 
 
 		 427 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  43.22 
 
 		 427 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  42.99 
 
 		 427 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  46.08 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  44.89 
 
 		 427 aa  353  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 		 425 aa  352  8e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  42.59 
 
 		 435 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  41.72 
 
 		 435 aa  351  1e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  42.59 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  44.92 
 
 		 429 aa  349  5e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  42.59 
 
 		 435 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  45.39 
 
 		 441 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  42.96 
 
 		 427 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  42.52 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  42.35 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  41.81 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  42.12 
 
 		 435 aa  346  6e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  42.19 
 
 		 427 aa  345  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  41.59 
 
 		 435 aa  345  8e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 427 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  47.67 
 
 		 421 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>