More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1741 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 441 aa  898    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  67.34 
 
 		 449 aa  585  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  55.41 
 
 		 435 aa  501  1e-141  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  55.43 
 
 		 437 aa  456  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  51.52 
 
 		 430 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  51.28 
 
 		 430 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  52.91 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  52.91 
 
 		 430 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  52.91 
 
 		 430 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  51.98 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  52.04 
 
 		 433 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  52.47 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  51.76 
 
 		 433 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  51.52 
 
 		 433 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  51.52 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  51.52 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  51.28 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  50.82 
 
 		 425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  51.05 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  48.41 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  48.48 
 
 		 468 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  49.18 
 
 		 429 aa  388  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  50.12 
 
 		 430 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  48.25 
 
 		 468 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  47.82 
 
 		 434 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  46.21 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  48.25 
 
 		 468 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  47.36 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  45.39 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  48.72 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  47.36 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  47.36 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  46.54 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  46.21 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  47.1 
 
 		 438 aa  372  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  45.68 
 
 		 439 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  46.64 
 
 		 419 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  44.09 
 
 		 439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  44.32 
 
 		 439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  44.06 
 
 		 431 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  43.52 
 
 		 437 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 436 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  43.82 
 
 		 431 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  43.22 
 
 		 437 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  43.59 
 
 		 431 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00465  oxidoreductase  49.53 
 
 		 438 aa  351  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.835263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  43.12 
 
 		 431 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  44.55 
 
 		 430 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  42.52 
 
 		 437 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  41.16 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  41.16 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  41.16 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  41.16 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  41.16 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  41.16 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  41.16 
 
 		 426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  41.16 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.93 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  43.44 
 
 		 430 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  44.86 
 
 		 423 aa  334  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  40.79 
 
 		 426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  39.35 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 440 aa  324  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  38.69 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  38.69 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  42.92 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  38.93 
 
 		 435 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  37.53 
 
 		 434 aa  323  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  39.53 
 
 		 435 aa  323  5e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  42.65 
 
 		 430 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  37.3 
 
 		 435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  42.65 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 		 433 aa  319  7e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  42.52 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  43.62 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  42.52 
 
 		 433 aa  317  4e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 		 429 aa  316  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  39.02 
 
 		 427 aa  316  6e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  38 
 
 		 435 aa  316  6e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 435 aa  315  9e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  38.17 
 
 		 427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  37.76 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  39.44 
 
 		 428 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  39.44 
 
 		 428 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  39.44 
 
 		 428 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  39.11 
 
 		 427 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  39.26 
 
 		 428 aa  311  2e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  40.37 
 
 		 421 aa  311  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  39.44 
 
 		 428 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  39.3 
 
 		 428 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  39.3 
 
 		 428 aa  310  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  41.69 
 
 		 427 aa  310  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  39.95 
 
 		 427 aa  309  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  38.55 
 
 		 428 aa  309  8e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  39.07 
 
 		 428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  44.21 
 
 		 424 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>