More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3004 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  91.49 
 
 		 435 aa  835    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  98.39 
 
 		 435 aa  884    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  90.11 
 
 		 435 aa  821    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  89.66 
 
 		 435 aa  818    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  76.78 
 
 		 435 aa  706    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  76.78 
 
 		 435 aa  714    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  76.55 
 
 		 435 aa  704    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  87.82 
 
 		 435 aa  801    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  75.34 
 
 		 434 aa  680    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  75.63 
 
 		 435 aa  702    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  90.11 
 
 		 435 aa  822    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  98.39 
 
 		 435 aa  884    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 435 aa  902    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  77.7 
 
 		 435 aa  721    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  89.66 
 
 		 435 aa  817    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  59.16 
 
 		 437 aa  534  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  59.15 
 
 		 437 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  59.39 
 
 		 437 aa  531  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  58.31 
 
 		 436 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  58.28 
 
 		 439 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  58.04 
 
 		 439 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  57.82 
 
 		 438 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  58.28 
 
 		 430 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  57.81 
 
 		 430 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  57.58 
 
 		 430 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  53.76 
 
 		 431 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  57.58 
 
 		 430 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  53.29 
 
 		 431 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  53.29 
 
 		 431 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  51.88 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  51.85 
 
 		 433 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  45.01 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  42.22 
 
 		 428 aa  371  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  45.48 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  42.3 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  43.26 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  43.03 
 
 		 430 aa  362  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  41.71 
 
 		 427 aa  360  2e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  41.34 
 
 		 440 aa  358  9e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  42.12 
 
 		 428 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  42.26 
 
 		 437 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  41.77 
 
 		 428 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  41.77 
 
 		 428 aa  355  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  41.53 
 
 		 428 aa  353  4e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  41.53 
 
 		 428 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 		 435 aa  351  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 		 427 aa  351  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  41.53 
 
 		 428 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  42.08 
 
 		 426 aa  350  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 		 429 aa  350  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  40.28 
 
 		 428 aa  349  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  41.49 
 
 		 430 aa  350  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  42.59 
 
 		 435 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  41.29 
 
 		 428 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  41.29 
 
 		 428 aa  349  5e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 		 427 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.9 
 
 		 426 aa  348  8e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  40.9 
 
 		 426 aa  348  9e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.9 
 
 		 426 aa  348  9e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 		 427 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  42.55 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  40.76 
 
 		 427 aa  348  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  41.05 
 
 		 428 aa  348  1e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  40.66 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  40.66 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  40.66 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 		 427 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.66 
 
 		 426 aa  347  2e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  40.28 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  41.71 
 
 		 427 aa  345  7e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.66 
 
 		 426 aa  345  7e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 		 427 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  40.57 
 
 		 428 aa  345  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  42.36 
 
 		 428 aa  345  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.19 
 
 		 426 aa  345  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  40.69 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 		 429 aa  343  2e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  40.76 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 429 aa  343  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  40.05 
 
 		 427 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  41.88 
 
 		 435 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  41.26 
 
 		 430 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  41.26 
 
 		 430 aa  342  8e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  40.84 
 
 		 429 aa  342  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  41.03 
 
 		 430 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 429 aa  340  4e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 436 aa  339  7e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  40.57 
 
 		 440 aa  335  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 		 429 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  40.33 
 
 		 449 aa  335  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  41 
 
 		 427 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  41.59 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  40.19 
 
 		 429 aa  333  5e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1938  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 		 429 aa  332  6e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2421  FAD dependent oxidoreductase  42.08 
 
 		 429 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>