More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3843 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3765  putative oxidoreductase  78.9 
 
 
452 aa  709    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  94.71 
 
 
435 aa  863    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  78.4 
 
 
427 aa  709    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  94.48 
 
 
435 aa  863    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  94.02 
 
 
435 aa  858    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
435 aa  900    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  82.39 
 
 
437 aa  743    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44260  putative oxidoreductase  79.36 
 
 
436 aa  712    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  67.45 
 
 
429 aa  594  1e-169  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  63.08 
 
 
429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  61.92 
 
 
429 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  61.68 
 
 
429 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  60.47 
 
 
429 aa  557  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  60.94 
 
 
429 aa  557  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2421  FAD dependent oxidoreductase  62.38 
 
 
429 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347894  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1537  FAD dependent oxidoreductase  61.18 
 
 
429 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000289011  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1938  FAD dependent oxidoreductase  62.15 
 
 
429 aa  554  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  60.42 
 
 
429 aa  550  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  60.19 
 
 
429 aa  549  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  60.19 
 
 
429 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2410  FAD dependent oxidoreductase  61.68 
 
 
429 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.269083  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  59.25 
 
 
429 aa  541  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2176  FAD dependent oxidoreductase  60.75 
 
 
429 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.930184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 
428 aa  359  5e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  43.5 
 
 
435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  42.23 
 
 
435 aa  354  2e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 
428 aa  352  7e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 
440 aa  352  7e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  42.12 
 
 
435 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 
434 aa  348  9e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  41.81 
 
 
427 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  41.88 
 
 
435 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  41.98 
 
 
435 aa  347  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  41.41 
 
 
435 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  41.65 
 
 
435 aa  346  5e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  41.18 
 
 
435 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  40.66 
 
 
428 aa  345  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  41.41 
 
 
435 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  41.57 
 
 
427 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  43.44 
 
 
437 aa  343  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  42.35 
 
 
435 aa  343  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  42.35 
 
 
435 aa  342  5e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  41.88 
 
 
435 aa  342  7e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  43.86 
 
 
439 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  43.51 
 
 
437 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 
427 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  40.38 
 
 
427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  40.38 
 
 
427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  41.33 
 
 
427 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  40.38 
 
 
427 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 
435 aa  339  5e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  43.41 
 
 
439 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  40.38 
 
 
428 aa  338  9e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  40.86 
 
 
427 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  40.86 
 
 
428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  40.94 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  43.79 
 
 
437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 
428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
428 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
428 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 
428 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  44.1 
 
 
438 aa  336  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 
428 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 
428 aa  336  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  41.23 
 
 
436 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
428 aa  335  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  41.12 
 
 
426 aa  332  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  40.38 
 
 
427 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  39.43 
 
 
428 aa  330  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  39.72 
 
 
428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  40.93 
 
 
427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  42.56 
 
 
436 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  39.48 
 
 
427 aa  323  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 
428 aa  323  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  40.62 
 
 
427 aa  322  7e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  40.65 
 
 
431 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  40.65 
 
 
431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  40.89 
 
 
431 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  40.42 
 
 
431 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  42.75 
 
 
430 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  39.1 
 
 
433 aa  317  3e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  39.25 
 
 
426 aa  315  8e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  39.25 
 
 
426 aa  315  8e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  39.25 
 
 
426 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  39.25 
 
 
426 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  39.25 
 
 
426 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  39.25 
 
 
426 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  39.25 
 
 
426 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  39.25 
 
 
426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  39.25 
 
 
426 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  38.95 
 
 
427 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
429 aa  312  6.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  40.71 
 
 
430 aa  312  9e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  42.03 
 
 
430 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
433 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 
425 aa  310  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  40.43 
 
 
430 aa  306  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  37.94 
 
 
427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  39.81 
 
 
430 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 
423 aa  303  6.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>