More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3146 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  98.61 
 
 		 431 aa  865    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  100 
 
 		 431 aa  877    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  76.98 
 
 		 433 aa  682    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  89.79 
 
 		 431 aa  796    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  96.29 
 
 		 431 aa  848    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  67.52 
 
 		 439 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  67.52 
 
 		 439 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  65.42 
 
 		 437 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  65.88 
 
 		 436 aa  595  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  64.78 
 
 		 437 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  65.41 
 
 		 437 aa  588  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  65.88 
 
 		 438 aa  570  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  64.02 
 
 		 430 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  63.32 
 
 		 430 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  64.23 
 
 		 430 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  64.23 
 
 		 430 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  54.46 
 
 		 435 aa  488  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  53.99 
 
 		 435 aa  484  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  54.46 
 
 		 435 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  54.46 
 
 		 435 aa  487  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  54.46 
 
 		 435 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  53.29 
 
 		 435 aa  481  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  53.76 
 
 		 435 aa  480  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  53.29 
 
 		 435 aa  475  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  53.29 
 
 		 435 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  53.99 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  52.58 
 
 		 435 aa  474  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  52.09 
 
 		 435 aa  471  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  50.94 
 
 		 435 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  50.7 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  49.17 
 
 		 435 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  50.35 
 
 		 430 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  47.67 
 
 		 430 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  50.58 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  47.09 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  46.67 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  46.44 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  46.5 
 
 		 427 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  49.19 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  44.39 
 
 		 427 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  48.26 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  45.56 
 
 		 427 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  44.63 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  44.71 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  48.49 
 
 		 430 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 428 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  48.49 
 
 		 430 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  44.39 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  44.71 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  44.03 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  45.33 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  45.33 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  45.33 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 428 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  44.39 
 
 		 427 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  45.33 
 
 		 426 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  44 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  48.25 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  44.16 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  44 
 
 		 428 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  44.47 
 
 		 428 aa  378  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  44.24 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  43.76 
 
 		 428 aa  373  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  47.79 
 
 		 433 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  47.55 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  45.09 
 
 		 426 aa  375  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  45.09 
 
 		 426 aa  375  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  45.09 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  47.91 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  44.63 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  46.21 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  48.02 
 
 		 433 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  44.86 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  45.79 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  45.33 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  41.72 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  47.32 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  42.99 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  42.86 
 
 		 428 aa  364  2e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  43.56 
 
 		 435 aa  363  4e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  42.35 
 
 		 427 aa  355  5.999999999999999e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  43.82 
 
 		 441 aa  352  8.999999999999999e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  42.66 
 
 		 429 aa  348  8e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  41.92 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  40.98 
 
 		 433 aa  348  2e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  45.52 
 
 		 423 aa  345  6e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  43.84 
 
 		 449 aa  345  7e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 429 aa  344  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 429 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  45.28 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  41.41 
 
 		 428 aa  341  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  42.02 
 
 		 429 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  40.05 
 
 		 428 aa  339  7e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1938  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 		 429 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2176  FAD dependent oxidoreductase  42.25 
 
 		 429 aa  333  3e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.930184  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  41.41 
 
 		 427 aa  332  9e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  41.47 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2410  FAD dependent oxidoreductase  42.25 
 
 		 429 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.269083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>