More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2052 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2410  FAD dependent oxidoreductase  86.95 
 
 		 429 aa  772    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.269083  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2421  FAD dependent oxidoreductase  86.95 
 
 		 429 aa  776    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347894  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  100 
 
 		 429 aa  895    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1938  FAD dependent oxidoreductase  86.71 
 
 		 429 aa  777    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  76.71 
 
 		 429 aa  698    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  69 
 
 		 429 aa  644    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  94.87 
 
 		 429 aa  854    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2176  FAD dependent oxidoreductase  87.41 
 
 		 429 aa  779    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.930184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  86.25 
 
 		 429 aa  783    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  74.36 
 
 		 429 aa  685    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1537  FAD dependent oxidoreductase  71.79 
 
 		 429 aa  664    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000289011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  71.33 
 
 		 429 aa  662    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  94.87 
 
 		 429 aa  853    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  94.64 
 
 		 429 aa  850    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  62.85 
 
 		 437 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  61.54 
 
 		 429 aa  567  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  60.89 
 
 		 435 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  60.42 
 
 		 435 aa  548  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3765  putative oxidoreductase  61.92 
 
 		 452 aa  548  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  60.66 
 
 		 427 aa  549  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  60.66 
 
 		 435 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44260  putative oxidoreductase  61.68 
 
 		 436 aa  544  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  59.25 
 
 		 435 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  42.89 
 
 		 435 aa  360  4e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  41.98 
 
 		 435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  43.59 
 
 		 439 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 		 431 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  43.36 
 
 		 439 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  43.26 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  42.66 
 
 		 431 aa  348  8e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  43.03 
 
 		 435 aa  348  8e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  42.32 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  42.55 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  41.37 
 
 		 435 aa  347  2e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  42.49 
 
 		 437 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  42.19 
 
 		 431 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  42.25 
 
 		 437 aa  345  8e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 		 435 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  41.31 
 
 		 437 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 435 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 		 434 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 435 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 		 435 aa  342  7e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  40.66 
 
 		 435 aa  341  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  41.37 
 
 		 435 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 440 aa  340  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  42.42 
 
 		 438 aa  338  9.999999999999999e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  42.34 
 
 		 430 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 436 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  40.33 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  39.06 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  40.14 
 
 		 427 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 433 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  40.14 
 
 		 427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  39.01 
 
 		 428 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  39.01 
 
 		 428 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 		 436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  38.77 
 
 		 428 aa  319  5e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  38.55 
 
 		 428 aa  319  6e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 		 428 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  38.52 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  39.67 
 
 		 430 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  38.28 
 
 		 428 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  39.9 
 
 		 430 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  38.28 
 
 		 428 aa  317  3e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  41.36 
 
 		 430 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 		 427 aa  316  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  38.81 
 
 		 428 aa  315  7e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 		 427 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  39.38 
 
 		 427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  39.38 
 
 		 427 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  39.38 
 
 		 427 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  40.15 
 
 		 428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  38.15 
 
 		 427 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 		 428 aa  311  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  37.59 
 
 		 428 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  39.01 
 
 		 427 aa  310  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  39.52 
 
 		 427 aa  309  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 		 435 aa  309  6.999999999999999e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  38.68 
 
 		 437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  38.97 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 		 427 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  37.95 
 
 		 433 aa  306  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  39.48 
 
 		 430 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  36.9 
 
 		 427 aa  306  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  38.23 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  37.83 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  37.86 
 
 		 423 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  37.83 
 
 		 426 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  37.83 
 
 		 426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  37.83 
 
 		 426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  37.83 
 
 		 426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  37.83 
 
 		 426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  37.83 
 
 		 426 aa  303  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  39.34 
 
 		 430 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  39.34 
 
 		 430 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>