More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2421 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  86.95 
 
 
429 aa  791    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  74.83 
 
 
429 aa  683    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  72.96 
 
 
429 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2410  FAD dependent oxidoreductase  96.74 
 
 
429 aa  844    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.269083  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  87.65 
 
 
429 aa  798    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2421  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
429 aa  890    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347894  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2176  FAD dependent oxidoreductase  95.57 
 
 
429 aa  837    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.930184  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2722  FAD dependent oxidoreductase  72.96 
 
 
429 aa  671    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180359 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  78.12 
 
 
429 aa  702    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1938  FAD dependent oxidoreductase  97.2 
 
 
429 aa  853    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1537  FAD dependent oxidoreductase  70.63 
 
 
429 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000289011  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  87.41 
 
 
429 aa  796    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  87.65 
 
 
429 aa  796    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  96.27 
 
 
429 aa  860    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  64.57 
 
 
429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  63.55 
 
 
435 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  63.08 
 
 
435 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  63.62 
 
 
437 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  63.08 
 
 
435 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  62.38 
 
 
435 aa  568  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  61.36 
 
 
427 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3765  putative oxidoreductase  62.91 
 
 
452 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44260  putative oxidoreductase  63.15 
 
 
436 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  43.66 
 
 
437 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  42.45 
 
 
435 aa  352  5e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 
437 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  42.96 
 
 
437 aa  352  8.999999999999999e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  42.79 
 
 
435 aa  349  6e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  41.47 
 
 
428 aa  349  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  43.57 
 
 
435 aa  348  7e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  43.56 
 
 
439 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  42.23 
 
 
431 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  42.08 
 
 
435 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  42 
 
 
431 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 
435 aa  343  5e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  42.89 
 
 
438 aa  342  9e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  40.8 
 
 
428 aa  342  9e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 
435 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 
435 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  42.32 
 
 
435 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  41.69 
 
 
431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  43.09 
 
 
439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  42.32 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  41.84 
 
 
435 aa  340  4e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 
435 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  41.45 
 
 
431 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  41.43 
 
 
427 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 
440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  40.62 
 
 
427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  40.62 
 
 
427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 
434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  41.37 
 
 
435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 
435 aa  336  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  39.53 
 
 
428 aa  334  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  39.53 
 
 
428 aa  334  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 
428 aa  334  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
428 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
428 aa  333  4e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
428 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  43.26 
 
 
436 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  39.06 
 
 
428 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  39.06 
 
 
428 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  40.81 
 
 
427 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  40.57 
 
 
427 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  40.57 
 
 
427 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  40.57 
 
 
427 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  40.57 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  39.29 
 
 
428 aa  325  7e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  38.59 
 
 
428 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 
427 aa  322  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  38.12 
 
 
428 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  42.09 
 
 
430 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  39.61 
 
 
428 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  37.88 
 
 
427 aa  320  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  40.52 
 
 
433 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  40.86 
 
 
436 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  38.42 
 
 
433 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  40.52 
 
 
427 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 
428 aa  315  7e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  39.19 
 
 
427 aa  315  7e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  40.14 
 
 
430 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  39.67 
 
 
430 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  39.68 
 
 
426 aa  311  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  42.03 
 
 
430 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  38.11 
 
 
427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  38.68 
 
 
437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  40.24 
 
 
430 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 
435 aa  302  8.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 
441 aa  299  6e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 
429 aa  298  8e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  39.1 
 
 
430 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  38.33 
 
 
423 aa  297  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  39.1 
 
 
430 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 
425 aa  296  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  37.9 
 
 
449 aa  296  6e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  38.86 
 
 
430 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  36.47 
 
 
426 aa  293  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  36.47 
 
 
426 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>