More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0242 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  76.38 
 
 		 437 aa  691    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  77.29 
 
 		 437 aa  699    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  77.1 
 
 		 430 aa  662    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  78.03 
 
 		 436 aa  701    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 437 aa  894    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  77.34 
 
 		 430 aa  662    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  78.49 
 
 		 439 aa  706    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  78.26 
 
 		 439 aa  708    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  75 
 
 		 430 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  75 
 
 		 430 aa  618  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  69.58 
 
 		 438 aa  607  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  66.35 
 
 		 431 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  65.65 
 
 		 431 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  65.41 
 
 		 431 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  64.94 
 
 		 431 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  65.96 
 
 		 433 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  61.81 
 
 		 435 aa  555  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  61.34 
 
 		 435 aa  551  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  60.56 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  60.56 
 
 		 435 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  60.32 
 
 		 435 aa  542  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  60.79 
 
 		 435 aa  542  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  60.32 
 
 		 435 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  59.86 
 
 		 435 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  59.86 
 
 		 435 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  59.63 
 
 		 435 aa  534  1e-150  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  58.99 
 
 		 435 aa  531  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  59.16 
 
 		 435 aa  534  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  59.72 
 
 		 434 aa  530  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  58 
 
 		 435 aa  530  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  57.47 
 
 		 435 aa  521  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  50.12 
 
 		 430 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  49.08 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  49.08 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  48.95 
 
 		 430 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  49.08 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  49.08 
 
 		 430 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  47.9 
 
 		 427 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  47.66 
 
 		 427 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  48.95 
 
 		 430 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  45.97 
 
 		 428 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  45.99 
 
 		 428 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  47.98 
 
 		 427 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  46.56 
 
 		 427 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  43.71 
 
 		 440 aa  391  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  46.56 
 
 		 427 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  46.56 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  46.23 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  46.79 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  46.23 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  45.99 
 
 		 428 aa  388  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  48.95 
 
 		 430 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  45.28 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  45.28 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  45.28 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  46.23 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  45.73 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  46.56 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  45.28 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  45.52 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  47.61 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  45.28 
 
 		 428 aa  383  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  47.79 
 
 		 427 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  45.05 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  46.21 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  46.94 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  46.47 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  47.74 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  46.7 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  46.7 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  43.87 
 
 		 428 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  44.6 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  44.6 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  44.6 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  44.6 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  44.13 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  44.6 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  44.6 
 
 		 426 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  44.6 
 
 		 426 aa  371  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  43.63 
 
 		 427 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  45.07 
 
 		 426 aa  368  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  44.13 
 
 		 426 aa  365  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  45.33 
 
 		 433 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  44.44 
 
 		 449 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  45.05 
 
 		 423 aa  360  2e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  44.16 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  43.22 
 
 		 435 aa  359  7e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  44.42 
 
 		 427 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  44.31 
 
 		 429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  43.9 
 
 		 436 aa  355  6.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  46.1 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  43.52 
 
 		 441 aa  353  2.9999999999999997e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 		 429 aa  352  7e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  44.49 
 
 		 435 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  44.72 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  41.2 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  44.27 
 
 		 435 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  41.98 
 
 		 427 aa  348  1e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  42.25 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>