More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1057 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  77.24 
 
 		 435 aa  712    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  76.32 
 
 		 435 aa  709    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  76.55 
 
 		 435 aa  706    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  76.78 
 
 		 435 aa  708    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  75.86 
 
 		 435 aa  703    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  80.46 
 
 		 434 aa  739    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  85.75 
 
 		 435 aa  803    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  76.32 
 
 		 435 aa  706    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 435 aa  900    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  76.09 
 
 		 435 aa  701    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  80.46 
 
 		 435 aa  740    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  76.32 
 
 		 435 aa  708    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  75.63 
 
 		 435 aa  702    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  73.56 
 
 		 435 aa  691    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  76.78 
 
 		 435 aa  709    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  58.22 
 
 		 437 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  57.47 
 
 		 437 aa  521  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  57.28 
 
 		 437 aa  511  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  58.31 
 
 		 436 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  58.54 
 
 		 430 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  55.13 
 
 		 438 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  56.44 
 
 		 439 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  55.92 
 
 		 439 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  58.35 
 
 		 430 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  57.8 
 
 		 430 aa  472  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  58.05 
 
 		 430 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  49.53 
 
 		 433 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  49.64 
 
 		 431 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  49.17 
 
 		 431 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  49.53 
 
 		 431 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  48.47 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  45.26 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  44.44 
 
 		 430 aa  378  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  44.68 
 
 		 430 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  43.87 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  45.26 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 		 440 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  43.6 
 
 		 428 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2142  FAD dependent oxidoreductase  43.16 
 
 		 427 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  43.84 
 
 		 428 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  43.6 
 
 		 428 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0778  FAD dependent oxidoreductase  43.16 
 
 		 429 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0594018  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  43.6 
 
 		 428 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1835  FAD dependent oxidoreductase  44.29 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2193  FAD dependent oxidoreductase  44.31 
 
 		 429 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  43.36 
 
 		 428 aa  360  4e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  42.89 
 
 		 428 aa  360  4e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1784  FAD dependent oxidoreductase  44.05 
 
 		 429 aa  359  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  43.16 
 
 		 428 aa  359  6e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  42.89 
 
 		 428 aa  358  8e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  41.94 
 
 		 428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4055  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 		 435 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.80988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  42.76 
 
 		 433 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2052  oxidoreductase  43.1 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  41.94 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1341  FAD dependent oxidoreductase  43.26 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268345  normal  0.168111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  40.94 
 
 		 430 aa  353  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  41.23 
 
 		 427 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 		 433 aa  352  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4365  FAD dependent oxidoreductase  41.61 
 
 		 437 aa  351  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4548  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 		 435 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  42.55 
 
 		 433 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 		 433 aa  349  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  41.71 
 
 		 427 aa  349  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  42.79 
 
 		 433 aa  348  8e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2528  FAD dependent oxidoreductase  43.57 
 
 		 429 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.642393 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  42.28 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  41.59 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  42.18 
 
 		 427 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  41.36 
 
 		 430 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  41.36 
 
 		 430 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  41.47 
 
 		 427 aa  346  6e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2077  oxidoreductase  42.28 
 
 		 429 aa  345  7e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  41 
 
 		 427 aa  345  8e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  43.17 
 
 		 428 aa  345  1e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  41.47 
 
 		 427 aa  345  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 		 427 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1938  FAD dependent oxidoreductase  44.05 
 
 		 429 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1866  FAD dependent oxidoreductase  39.76 
 
 		 429 aa  341  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106095  hitchhiker  0.00126113 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2176  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 		 429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.930184  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3843  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 		 435 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 429 aa  339  7e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2421  FAD dependent oxidoreductase  43.57 
 
 		 429 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.52 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  40.52 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  40.52 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.52 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  40.52 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.52 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  39.9 
 
 		 468 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  39.9 
 
 		 468 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  40.52 
 
 		 426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  40.52 
 
 		 426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  41.41 
 
 		 426 aa  337  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>