More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2032 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  99.08 
 
 		 433 aa  861    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  88.68 
 
 		 433 aa  779    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 433 aa  868    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  66.67 
 
 		 436 aa  572  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  62.44 
 
 		 436 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  54.29 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  57.04 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  54.5 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  51.18 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  46.32 
 
 		 425 aa  390  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  47.64 
 
 		 427 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  48.93 
 
 		 429 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  48.05 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  46.21 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  45.11 
 
 		 430 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  46.21 
 
 		 430 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  45.97 
 
 		 430 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  45.32 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  45.5 
 
 		 430 aa  359  6e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  47.39 
 
 		 433 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  46.45 
 
 		 433 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  46.45 
 
 		 433 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  46.21 
 
 		 433 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  42.79 
 
 		 427 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  45.65 
 
 		 433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  46.45 
 
 		 433 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  43.03 
 
 		 427 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  41.37 
 
 		 427 aa  350  3e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  42.79 
 
 		 427 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 		 427 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  41.37 
 
 		 427 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 		 427 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  42.08 
 
 		 427 aa  348  9e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  45.63 
 
 		 430 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  44.63 
 
 		 435 aa  347  3e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  45.13 
 
 		 428 aa  346  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  44.89 
 
 		 428 aa  344  1e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  42.55 
 
 		 427 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  46.14 
 
 		 437 aa  343  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  46.59 
 
 		 439 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  44.89 
 
 		 432 aa  342  8e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  41.43 
 
 		 428 aa  341  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  42.82 
 
 		 426 aa  339  5e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 		 426 aa  339  5e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  41.75 
 
 		 428 aa  339  5e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  42.82 
 
 		 426 aa  339  5e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  42.82 
 
 		 426 aa  339  5e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  42.82 
 
 		 426 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 		 426 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  42.82 
 
 		 426 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  45.67 
 
 		 437 aa  339  7e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 		 428 aa  338  9e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 		 428 aa  338  9e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 		 440 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  41.27 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  42.75 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  42.82 
 
 		 426 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  41.75 
 
 		 428 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  41.51 
 
 		 427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  42.35 
 
 		 426 aa  336  5e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 		 428 aa  336  5.999999999999999e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  45.63 
 
 		 430 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 428 aa  335  9e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  45.52 
 
 		 439 aa  335  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  41.51 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  41.04 
 
 		 428 aa  334  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  47.68 
 
 		 430 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  46.57 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  40.99 
 
 		 428 aa  334  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  41.33 
 
 		 428 aa  333  4e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 		 436 aa  333  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  44.19 
 
 		 437 aa  332  6e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  41.04 
 
 		 428 aa  330  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  45.13 
 
 		 428 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  39.01 
 
 		 428 aa  330  4e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0364  FAD dependent oxidoreductase  45.84 
 
 		 431 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  46.83 
 
 		 430 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  47.88 
 
 		 424 aa  329  6e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 		 428 aa  329  6e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  39.44 
 
 		 433 aa  329  8e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  41.92 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  46.19 
 
 		 438 aa  326  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0799  oxidoreductase  44.89 
 
 		 427 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0160  FAD dependent oxidoreductase  46.08 
 
 		 428 aa  324  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  40.85 
 
 		 435 aa  322  6e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  46.06 
 
 		 437 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  41.81 
 
 		 427 aa  319  7e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  39.44 
 
 		 435 aa  319  7e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  43.33 
 
 		 431 aa  318  9e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  44.66 
 
 		 425 aa  318  9e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  43.09 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  42.52 
 
 		 441 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  40.94 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 		 427 aa  316  4e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 434 aa  316  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  41.84 
 
 		 435 aa  315  7e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  42.73 
 
 		 433 aa  315  8e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  42.62 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  42.49 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>