More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0396 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
432 aa  885    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0799  oxidoreductase  73 
 
 
427 aa  636    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0364  FAD dependent oxidoreductase  90.51 
 
 
431 aa  788    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  69.56 
 
 
436 aa  632  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  65.49 
 
 
428 aa  579  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  65.96 
 
 
428 aa  575  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  65.26 
 
 
428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0160  FAD dependent oxidoreductase  65.41 
 
 
428 aa  551  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  54.25 
 
 
427 aa  476  1e-133  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  44.79 
 
 
428 aa  355  6.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  44.89 
 
 
433 aa  342  8e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  44.26 
 
 
433 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  44.66 
 
 
433 aa  338  8e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  45.37 
 
 
436 aa  332  8e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  44.02 
 
 
434 aa  316  6e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  42.66 
 
 
439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  40.94 
 
 
436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  37.8 
 
 
423 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  37.89 
 
 
430 aa  291  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  37.17 
 
 
430 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 
453 aa  286  4e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  36.84 
 
 
430 aa  282  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  37.08 
 
 
430 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  36.84 
 
 
430 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  36.45 
 
 
430 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  36.28 
 
 
425 aa  279  6e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  37.95 
 
 
433 aa  278  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  39.33 
 
 
421 aa  275  8e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  39.86 
 
 
438 aa  273  5.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  36.77 
 
 
435 aa  266  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 
429 aa  266  7e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 
433 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 
433 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 
433 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  35.5 
 
 
441 aa  261  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  36.28 
 
 
433 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  36.92 
 
 
439 aa  260  4e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 
430 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  36.45 
 
 
439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 
435 aa  254  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  35.01 
 
 
449 aa  253  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 
436 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  36.32 
 
 
431 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  37.12 
 
 
437 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 
449 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  35.8 
 
 
425 aa  250  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 
429 aa  250  3e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  35.36 
 
 
431 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  35.7 
 
 
440 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  35.36 
 
 
431 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  36.15 
 
 
431 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  35.55 
 
 
437 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  36.64 
 
 
437 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 
435 aa  247  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 
433 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 
435 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 
435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  35.7 
 
 
434 aa  243  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 
435 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  36.62 
 
 
437 aa  240  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 
434 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 
430 aa  239  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 
430 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  34.91 
 
 
435 aa  238  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  34.47 
 
 
435 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 
430 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 
441 aa  236  7e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 
426 aa  236  8e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  34.69 
 
 
468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 
429 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 
429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  32.62 
 
 
426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 
426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  32.62 
 
 
426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.62 
 
 
426 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  34.45 
 
 
468 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.62 
 
 
426 aa  233  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  34.45 
 
 
468 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.39 
 
 
426 aa  232  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
426 aa  232  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.39 
 
 
426 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 
434 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  35.31 
 
 
429 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 
429 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.39 
 
 
426 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00465  oxidoreductase  36.99 
 
 
438 aa  230  4e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.835263  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3719  FAD dependent oxidoreductase  33.91 
 
 
429 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.0527853 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0347  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 
433 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0802  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 
429 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 
434 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 
434 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
433 aa  229  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 
435 aa  228  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 
435 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 
435 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 
439 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 
435 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>