More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0770 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  100 
 
 
428 aa  872    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  88.08 
 
 
428 aa  762    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  99.77 
 
 
428 aa  871    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  67.76 
 
 
436 aa  607  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  65.49 
 
 
432 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0160  FAD dependent oxidoreductase  65.19 
 
 
428 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0799  oxidoreductase  64.79 
 
 
427 aa  556  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0364  FAD dependent oxidoreductase  65.02 
 
 
431 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  53.04 
 
 
427 aa  484  1e-135  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  45.26 
 
 
428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  45.13 
 
 
433 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  44.66 
 
 
433 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  43.71 
 
 
433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  44.66 
 
 
436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  39.47 
 
 
423 aa  323  5e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  42.58 
 
 
434 aa  322  8e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  42.72 
 
 
439 aa  322  9.000000000000001e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  38.37 
 
 
430 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  38.37 
 
 
430 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  38.13 
 
 
430 aa  311  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 
436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  37.65 
 
 
430 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 
433 aa  306  6e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  37.62 
 
 
430 aa  301  1e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 
425 aa  301  1e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 
430 aa  301  2e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  36.9 
 
 
430 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  37.62 
 
 
433 aa  296  6e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  37.38 
 
 
433 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  37.62 
 
 
433 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 
433 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  38.92 
 
 
421 aa  290  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  36.73 
 
 
433 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  36.99 
 
 
425 aa  286  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  37.12 
 
 
439 aa  278  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  39.24 
 
 
453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 
437 aa  272  9e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  37.79 
 
 
438 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  36.88 
 
 
439 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  35.95 
 
 
430 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00465  oxidoreductase  38.19 
 
 
438 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.835263  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  36.92 
 
 
429 aa  270  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
435 aa  265  1e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  36.82 
 
 
437 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  34.79 
 
 
435 aa  263  6e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  34.55 
 
 
449 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  36.49 
 
 
449 aa  259  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 
436 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  35.63 
 
 
437 aa  257  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 
441 aa  255  9e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  34.84 
 
 
427 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  34.27 
 
 
428 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 
429 aa  254  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  34.61 
 
 
428 aa  253  3e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  36.02 
 
 
440 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 
430 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  35.31 
 
 
426 aa  252  9.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 
435 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 
431 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 
428 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 
430 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
428 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 
428 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 
428 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 
434 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 
431 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
435 aa  249  6e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 
428 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 
428 aa  249  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 
427 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 
428 aa  249  8e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 
434 aa  249  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 
435 aa  249  9e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  34.52 
 
 
431 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.29 
 
 
426 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 
426 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 
434 aa  248  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 
435 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 
428 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  34.29 
 
 
426 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 
426 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  34.29 
 
 
426 aa  248  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.29 
 
 
426 aa  248  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.29 
 
 
426 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  36.06 
 
 
468 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.52 
 
 
426 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 
435 aa  247  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 
435 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  31.42 
 
 
435 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 
435 aa  246  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  35.82 
 
 
468 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  34.05 
 
 
426 aa  245  9e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 
429 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  35.82 
 
 
468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 
427 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 
427 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  34.29 
 
 
428 aa  244  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  36.01 
 
 
430 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  33.64 
 
 
431 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  34.47 
 
 
441 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.372193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>