More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0301 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 436 aa  898    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  69.56 
 
 		 432 aa  632  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0364  FAD dependent oxidoreductase  70.02 
 
 		 431 aa  618  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  67.76 
 
 		 428 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  67.52 
 
 		 428 aa  605  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0799  oxidoreductase  70.42 
 
 		 427 aa  603  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  67.76 
 
 		 428 aa  593  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0160  FAD dependent oxidoreductase  63.55 
 
 		 428 aa  543  1e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  52.34 
 
 		 427 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  44.55 
 
 		 428 aa  362  9e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 		 433 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  43.3 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  43.47 
 
 		 433 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  43.54 
 
 		 436 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  40.19 
 
 		 434 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 		 439 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  36.04 
 
 		 430 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  35.56 
 
 		 430 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  35.56 
 
 		 430 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  35.08 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  37.97 
 
 		 453 aa  270  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 425 aa  266  5e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  35.87 
 
 		 433 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 		 433 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  34.53 
 
 		 433 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  34.53 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 		 425 aa  259  7e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  34.61 
 
 		 433 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 430 aa  256  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 		 430 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  33.81 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 		 433 aa  253  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 441 aa  246  6.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  34.04 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  34.52 
 
 		 439 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 		 421 aa  243  5e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  35.61 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  33.64 
 
 		 449 aa  239  1e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 429 aa  236  7e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  34.04 
 
 		 437 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  35.49 
 
 		 440 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  34.35 
 
 		 427 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 434 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  32.54 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 		 437 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  35.01 
 
 		 449 aa  229  6e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  35.39 
 
 		 468 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  35.53 
 
 		 439 aa  229  9e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 429 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 		 430 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  35.15 
 
 		 468 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 436 aa  226  6e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  35.15 
 
 		 468 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  34.05 
 
 		 441 aa  226  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 		 429 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5383  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 429 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199839  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  32.46 
 
 		 437 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0802  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 431 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  34.21 
 
 		 433 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 		 427 aa  224  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 431 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00465  oxidoreductase  35.08 
 
 		 438 aa  224  3e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.835263  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3719  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 		 429 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.0527853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 430 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  33.18 
 
 		 427 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 427 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 427 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 427 aa  220  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  34.12 
 
 		 443 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 427 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 435 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  32.22 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  31.98 
 
 		 427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 431 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  32.95 
 
 		 431 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 427 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1019  FAD dependent oxidoreductase  34.75 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  30.44 
 
 		 428 aa  213  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 436 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5183  FAD dependent oxidoreductase  33.58 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  32.03 
 
 		 435 aa  211  3e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5273  oxidoreductase, putative  33.58 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.194713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 435 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0826  FAD dependent oxidoreductase  31.68 
 
 		 437 aa  209  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>