More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0364 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  90.51 
 
 
432 aa  807    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0364  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
431 aa  886    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0799  oxidoreductase  71.83 
 
 
427 aa  627  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0301  FAD dependent oxidoreductase  70.02 
 
 
436 aa  630  1e-179  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  65.02 
 
 
428 aa  567  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  64.79 
 
 
428 aa  565  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  64.79 
 
 
428 aa  561  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0160  FAD dependent oxidoreductase  64.24 
 
 
428 aa  532  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  53.54 
 
 
427 aa  461  9.999999999999999e-129  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  43.13 
 
 
428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  45.84 
 
 
433 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  45.61 
 
 
433 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  44.26 
 
 
433 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  44.89 
 
 
436 aa  319  5e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  43.06 
 
 
434 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  41.23 
 
 
436 aa  299  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  41.26 
 
 
439 aa  295  1e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  41.46 
 
 
453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 
423 aa  282  8.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  37.17 
 
 
430 aa  279  7e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  36.69 
 
 
430 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  36.21 
 
 
430 aa  271  1e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  35.97 
 
 
430 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  35.97 
 
 
430 aa  270  4e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  35.97 
 
 
430 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  37.7 
 
 
433 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 
425 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  38.46 
 
 
421 aa  262  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  38.44 
 
 
438 aa  258  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 
433 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  35.8 
 
 
433 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  35.6 
 
 
441 aa  256  5e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  36.56 
 
 
435 aa  256  7e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 
433 aa  256  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  36.04 
 
 
433 aa  255  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 
430 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  34.61 
 
 
433 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  35.7 
 
 
439 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  36.64 
 
 
449 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 
429 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  35.14 
 
 
435 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  35.46 
 
 
439 aa  240  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  35.7 
 
 
440 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  34.1 
 
 
449 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 
431 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 
437 aa  237  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 
431 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  35.08 
 
 
425 aa  236  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 
434 aa  236  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  34.99 
 
 
431 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 
436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  34.99 
 
 
437 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2011  FAD dependent oxidoreductase  36 
 
 
437 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  35.21 
 
 
433 aa  233  6e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 
435 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 
431 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
429 aa  232  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 
430 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1194  FAD dependent oxidoreductase  34.17 
 
 
435 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.202233  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 
430 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1264  oxidoreductase  34.2 
 
 
435 aa  230  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  36.49 
 
 
434 aa  229  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 
435 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 
437 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  33.94 
 
 
435 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 
434 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  34.69 
 
 
468 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 
433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  34.06 
 
 
430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 
434 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  35.78 
 
 
434 aa  226  7e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2647  oxidoreductase  34.31 
 
 
435 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  33.25 
 
 
427 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  34.45 
 
 
468 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4280  FAD dependent oxidoreductase  34.22 
 
 
441 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.372193 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  33.73 
 
 
429 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  34.45 
 
 
468 aa  223  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  34.84 
 
 
443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2922  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 
435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3004  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.917445  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3101  FAD dependent oxidoreductase  33.49 
 
 
435 aa  221  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.76 
 
 
426 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 
426 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  31.76 
 
 
426 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.76 
 
 
426 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3014  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 
435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 
439 aa  219  5e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  33.82 
 
 
429 aa  219  7e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  31.53 
 
 
426 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4903  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
429 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.53 
 
 
426 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3463  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
429 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.53 
 
 
426 aa  219  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 
427 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  33.88 
 
 
427 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 
419 aa  218  2e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.53 
 
 
426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.53 
 
 
426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 
426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  33.88 
 
 
427 aa  217  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>