More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3113 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
427 aa  880    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5671  oxidoreductase  42.14 
 
 
424 aa  336  5.999999999999999e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  42.52 
 
 
425 aa  331  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2909  FAD dependent oxidoreductase  43.46 
 
 
425 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4967  FAD dependent oxidoreductase  41.13 
 
 
425 aa  329  6e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0475952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  42.42 
 
 
424 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 
424 aa  322  9.000000000000001e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5016  FAD dependent oxidoreductase  43.71 
 
 
424 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.208645  normal  0.555113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 
424 aa  315  8e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6675  FAD dependent oxidoreductase  40.76 
 
 
444 aa  315  9e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.411958  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6440  FAD dependent oxidoreductase  40.76 
 
 
444 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.458779  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6273  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 
425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.106536 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6061  FAD dependent oxidoreductase  39.57 
 
 
425 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  39.23 
 
 
428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 
444 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6065  FAD dependent oxidoreductase  42.06 
 
 
441 aa  306  6e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  37.68 
 
 
425 aa  305  7e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6362  FAD dependent oxidoreductase  41.59 
 
 
441 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.542904  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 
425 aa  293  5e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4421  FAD dependent oxidoreductase  38.63 
 
 
425 aa  292  6e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2186  FAD dependent oxidoreductase  39.91 
 
 
429 aa  292  7e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 
424 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  38 
 
 
424 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0248  oxidoreductase, FAD-binding protein  39.86 
 
 
424 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0158  FAD dependent oxidoreductase  39.62 
 
 
431 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 
424 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0057  FAD dependent oxidoreductase  36.71 
 
 
429 aa  282  9e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2946  FAD dependent oxidoreductase  36.81 
 
 
427 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0153  FAD dependent oxidoreductase  34.65 
 
 
436 aa  259  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.185015  hitchhiker  0.000196001 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5633  FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 
430 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  34.58 
 
 
430 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 
430 aa  239  8e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  34.99 
 
 
430 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  34.99 
 
 
430 aa  236  6e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  34.99 
 
 
430 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  34.74 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6342  FAD dependent oxidoreductase  35.41 
 
 
441 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 
430 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  33.03 
 
 
425 aa  229  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0567  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
435 aa  229  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  34.56 
 
 
432 aa  226  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 
436 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  36.39 
 
 
436 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  33.51 
 
 
439 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 
441 aa  223  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 
430 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  35.89 
 
 
436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  33.25 
 
 
439 aa  221  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  34.2 
 
 
428 aa  219  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 
433 aa  219  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  34.2 
 
 
428 aa  219  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 
433 aa  219  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  34.83 
 
 
427 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  34.91 
 
 
433 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 
431 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 
433 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 
432 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 
433 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 
433 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  34.66 
 
 
433 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  35.36 
 
 
435 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  37.96 
 
 
419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 
421 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 
425 aa  213  4.9999999999999996e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  35.26 
 
 
433 aa  213  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 
434 aa  213  7e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 
437 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 
434 aa  211  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 
433 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 
426 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.42 
 
 
426 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  32.58 
 
 
433 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.42 
 
 
426 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  33.42 
 
 
426 aa  210  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 
426 aa  210  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0364  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 
431 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 
432 aa  210  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.42 
 
 
426 aa  210  4e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  33.42 
 
 
426 aa  210  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  34.13 
 
 
428 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4840  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
445 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
428 aa  209  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  34.57 
 
 
433 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.42 
 
 
426 aa  208  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  32.38 
 
 
438 aa  207  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 
423 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0296  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 
427 aa  207  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  33.17 
 
 
426 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  30.88 
 
 
449 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  32.45 
 
 
429 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 
436 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1509  putative FAD dependent oxidoreductase  34.24 
 
 
445 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166671  normal  0.147012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6151  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 
445 aa  203  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 
428 aa  203  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 
430 aa  203  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 
428 aa  203  6e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 
426 aa  202  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.6 
 
 
428 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 
430 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>