More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0231 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 427 aa  866    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  52.27 
 
 		 436 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  52.27 
 
 		 436 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  49.53 
 
 		 430 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  51.31 
 
 		 436 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  48.33 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  47.89 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  47.42 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  47.38 
 
 		 429 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  47.43 
 
 		 431 aa  348  7e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  46.21 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  46.26 
 
 		 431 aa  340  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  42.96 
 
 		 436 aa  335  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  46.19 
 
 		 428 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  43.51 
 
 		 430 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  43.51 
 
 		 430 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  43.23 
 
 		 433 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  43.16 
 
 		 435 aa  325  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  46.19 
 
 		 428 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  38.79 
 
 		 427 aa  293  4e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  39.48 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  38.25 
 
 		 427 aa  276  7e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  40.97 
 
 		 427 aa  275  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  38 
 
 		 427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 427 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 		 428 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  38.22 
 
 		 435 aa  273  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  39.1 
 
 		 434 aa  273  3e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  37.69 
 
 		 427 aa  273  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  41.22 
 
 		 427 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  41.16 
 
 		 423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  41.54 
 
 		 427 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 		 433 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 427 aa  260  3e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  39.26 
 
 		 432 aa  259  6e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  35.85 
 
 		 434 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  35.46 
 
 		 436 aa  252  7e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  35.05 
 
 		 423 aa  250  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  36.27 
 
 		 428 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  36.54 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 		 478 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  36.03 
 
 		 428 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  38.88 
 
 		 432 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  37.87 
 
 		 431 aa  237  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  38.6 
 
 		 434 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  35.1 
 
 		 428 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  37.84 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  35.77 
 
 		 428 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 433 aa  222  8e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  35.03 
 
 		 430 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  35.03 
 
 		 430 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  35.03 
 
 		 430 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  36.02 
 
 		 428 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3113  FAD dependent oxidoreductase  34.83 
 
 		 427 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 		 430 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 		 427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  35.66 
 
 		 429 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  33.64 
 
 		 430 aa  216  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 		 435 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  35.25 
 
 		 427 aa  213  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  35.52 
 
 		 429 aa  211  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  32.34 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  36.43 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  32.32 
 
 		 427 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  33.96 
 
 		 427 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 		 428 aa  207  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 429 aa  206  4e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  36.53 
 
 		 430 aa  206  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  35.48 
 
 		 423 aa  205  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  32.79 
 
 		 430 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  31.85 
 
 		 427 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1940  FAD dependent oxidoreductase  35.43 
 
 		 439 aa  203  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0993886  normal  0.016736 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 427 aa  203  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 425 aa  202  9e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  30.35 
 
 		 427 aa  202  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  30.05 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  36.5 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  32.95 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3943  FAD dependent oxidoreductase  36.15 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  31.7 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  30.12 
 
 		 427 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  32.71 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  28.7 
 
 		 440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  33.88 
 
 		 438 aa  196  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 427 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 		 433 aa  196  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 429 aa  196  9e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 		 427 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  33.95 
 
 		 433 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  32.19 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>