More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0551 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 427 aa  880    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  69.65 
 
 		 428 aa  621  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  69.88 
 
 		 428 aa  621  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  66.75 
 
 		 428 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  66.04 
 
 		 429 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  64.71 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  64.71 
 
 		 428 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  64.94 
 
 		 478 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  64.24 
 
 		 428 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  50.47 
 
 		 428 aa  456  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  44.31 
 
 		 427 aa  359  5e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  43.71 
 
 		 427 aa  350  4e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  42.93 
 
 		 427 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  43.47 
 
 		 427 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  43.48 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 		 423 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  44.36 
 
 		 432 aa  343  4e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  43.93 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  41.73 
 
 		 427 aa  336  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  42.55 
 
 		 427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  41.59 
 
 		 427 aa  320  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  47.07 
 
 		 427 aa  319  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  42.41 
 
 		 429 aa  315  7e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  41.88 
 
 		 431 aa  299  8e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  40.14 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  38.41 
 
 		 431 aa  277  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  39.86 
 
 		 440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  38.5 
 
 		 436 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 427 aa  260  3e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  38.22 
 
 		 436 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  38.22 
 
 		 436 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 		 430 aa  253  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  38.35 
 
 		 429 aa  252  9.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  38.29 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 432 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 		 433 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  37.12 
 
 		 430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  37.68 
 
 		 435 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  36.87 
 
 		 430 aa  243  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  38.22 
 
 		 428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  40.61 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 		 435 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 431 aa  222  9e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 		 431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 		 434 aa  215  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  35.18 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 		 427 aa  200  3e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 433 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 		 433 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  33.08 
 
 		 436 aa  193  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 428 aa  187  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 428 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 		 428 aa  180  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 440 aa  180  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 428 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 428 aa  179  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  34.23 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  33.07 
 
 		 428 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  33.07 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  30.38 
 
 		 427 aa  176  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  33.96 
 
 		 427 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.81 
 
 		 428 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 434 aa  175  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 428 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  33.06 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  31.25 
 
 		 437 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  33.6 
 
 		 427 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 427 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 427 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 		 427 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.17 
 
 		 426 aa  169  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.17 
 
 		 426 aa  169  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  33.06 
 
 		 427 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 426 aa  169  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.17 
 
 		 426 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 426 aa  169  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.17 
 
 		 426 aa  169  9e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  31.17 
 
 		 426 aa  169  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  32.97 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.05 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  33.24 
 
 		 428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 436 aa  167  4e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  32.9 
 
 		 428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.65 
 
 		 426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 437 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 		 433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  27.94 
 
 		 436 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 		 429 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>