More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1037 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  76.62 
 
 		 436 aa  692    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 433 aa  872    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  93.76 
 
 		 433 aa  828    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  91.88 
 
 		 434 aa  804    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  47.9 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  44.79 
 
 		 435 aa  365  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  39.12 
 
 		 436 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  39.12 
 
 		 436 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  39.12 
 
 		 436 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  39.86 
 
 		 429 aa  272  7e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  39.95 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  38.08 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  39.14 
 
 		 427 aa  265  8e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  36.17 
 
 		 427 aa  263  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 		 433 aa  262  8e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  38.98 
 
 		 432 aa  259  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  39.23 
 
 		 432 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  38.19 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  35.56 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  38.29 
 
 		 427 aa  249  6e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  35.9 
 
 		 427 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  38.04 
 
 		 427 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  37.94 
 
 		 427 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  37.86 
 
 		 435 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  38.3 
 
 		 428 aa  244  3e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  37.37 
 
 		 428 aa  242  7e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 427 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  36.54 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 427 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 427 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 427 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  35.58 
 
 		 427 aa  239  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 		 440 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  34.5 
 
 		 427 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  36.05 
 
 		 430 aa  236  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  35.43 
 
 		 427 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  34.27 
 
 		 427 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  38.85 
 
 		 427 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  32.56 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  36.71 
 
 		 431 aa  229  7e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  34.88 
 
 		 427 aa  228  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  38.57 
 
 		 427 aa  227  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  33.8 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  38.22 
 
 		 429 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  36.52 
 
 		 423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  36.83 
 
 		 431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 		 428 aa  219  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  37.84 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 		 428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  34.21 
 
 		 428 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2415  FAD dependent oxidoreductase  32.93 
 
 		 436 aa  216  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342096  normal  0.0777393 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2124  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 427 aa  216  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.509963  normal  0.340468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 428 aa  213  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 428 aa  213  7e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  34.57 
 
 		 428 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 426 aa  210  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0977  FAD dependent oxidoreductase  31.29 
 
 		 428 aa  210  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  31.92 
 
 		 428 aa  209  7e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  33.01 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 434 aa  209  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.04 
 
 		 426 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.04 
 
 		 426 aa  207  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  31.04 
 
 		 426 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.04 
 
 		 426 aa  207  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.81 
 
 		 426 aa  206  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 426 aa  206  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.81 
 
 		 426 aa  206  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  31.29 
 
 		 428 aa  206  8e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.81 
 
 		 426 aa  206  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  37.95 
 
 		 427 aa  206  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  31.52 
 
 		 433 aa  205  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  40.75 
 
 		 431 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  30.81 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  32.3 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  32.3 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 436 aa  196  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 425 aa  195  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 423 aa  193  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 		 449 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 428 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  33.17 
 
 		 429 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  32.08 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 434 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  32 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  31.49 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  30.3 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  33.41 
 
 		 438 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>