More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4842 on replicon NC_009672
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
433 aa  883    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  60.47 
 
 
430 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  60.7 
 
 
430 aa  521  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  44.23 
 
 
431 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  44.65 
 
 
430 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  44.95 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  43.03 
 
 
436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  43.03 
 
 
436 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 
434 aa  336  5e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  45.32 
 
 
432 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  46.89 
 
 
431 aa  335  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  43.67 
 
 
436 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  41.65 
 
 
436 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  46.59 
 
 
429 aa  333  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  44.1 
 
 
432 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  43.23 
 
 
427 aa  330  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  46 
 
 
431 aa  320  3e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  42.35 
 
 
428 aa  300  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 
428 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  39.29 
 
 
434 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  37.74 
 
 
435 aa  270  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  39.16 
 
 
434 aa  268  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 
433 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  36.13 
 
 
433 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  38.03 
 
 
427 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  44.15 
 
 
427 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 
423 aa  253  6e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3646  FAD dependent oxidoreductase  38.73 
 
 
432 aa  252  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 
436 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  40.26 
 
 
427 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  36.3 
 
 
435 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  40 
 
 
427 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  36.08 
 
 
427 aa  247  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  38.64 
 
 
423 aa  246  6.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5527  FAD dependent oxidoreductase  38.28 
 
 
434 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.745168  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  36.05 
 
 
430 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  35.76 
 
 
430 aa  243  5e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  37.32 
 
 
433 aa  243  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  37.77 
 
 
427 aa  243  7e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 
428 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  39.4 
 
 
423 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  37.5 
 
 
427 aa  241  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  35.92 
 
 
433 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  33.65 
 
 
428 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  33.65 
 
 
428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  35.92 
 
 
433 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  35.97 
 
 
428 aa  239  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 
433 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  34.92 
 
 
430 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  35.51 
 
 
433 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  34.92 
 
 
430 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  34.47 
 
 
430 aa  236  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  37.06 
 
 
433 aa  236  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  35.23 
 
 
430 aa  235  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  35.93 
 
 
433 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  33.81 
 
 
428 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 
426 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 
427 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  39.07 
 
 
440 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  35.75 
 
 
433 aa  232  9e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 
427 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  33.33 
 
 
427 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
428 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2638  putative oxidoreductase  33.49 
 
 
428 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000755871  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  36.19 
 
 
433 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
428 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 
428 aa  228  2e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  36.07 
 
 
428 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  34.17 
 
 
428 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
428 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  32.78 
 
 
428 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  35.04 
 
 
428 aa  226  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  35.47 
 
 
478 aa  226  9e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  33.89 
 
 
429 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  36.19 
 
 
433 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  36.13 
 
 
430 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 
428 aa  224  3e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 
428 aa  224  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
427 aa  223  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3937  FAD dependent oxidoreductase  33.89 
 
 
428 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  39.11 
 
 
432 aa  223  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.49 
 
 
428 aa  223  7e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  33.89 
 
 
437 aa  222  9e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  33.41 
 
 
427 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  35.28 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 
433 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  31.94 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  34.99 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 
435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  35.13 
 
 
431 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0396  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 
432 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121903  normal  0.0540762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  30.72 
 
 
428 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6580  FAD dependent oxidoreductase  33.87 
 
 
442 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.785564  normal  0.194981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 
427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 
427 aa  217  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  31.94 
 
 
427 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  31.76 
 
 
426 aa  217  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  31.76 
 
 
426 aa  216  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 
426 aa  216  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>