More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4355 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  86.92 
 
 		 428 aa  756    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  100 
 
 		 428 aa  857    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  69.65 
 
 		 427 aa  621  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  67.29 
 
 		 428 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  67.29 
 
 		 428 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  67.29 
 
 		 428 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  67.52 
 
 		 478 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  66.11 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  64.95 
 
 		 428 aa  574  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  52.82 
 
 		 428 aa  475  1e-133  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  45.39 
 
 		 427 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  43.3 
 
 		 427 aa  344  1e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  43.27 
 
 		 423 aa  343  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  45.63 
 
 		 427 aa  343  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  44.9 
 
 		 427 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  43.88 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  43.65 
 
 		 427 aa  335  7e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  45.28 
 
 		 428 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  46.37 
 
 		 432 aa  333  4e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  46.89 
 
 		 423 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  48.06 
 
 		 427 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  45.87 
 
 		 427 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  44.05 
 
 		 427 aa  305  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  41.69 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  44.23 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  40.44 
 
 		 436 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  41.63 
 
 		 440 aa  270  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 		 431 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  39.13 
 
 		 436 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  39.13 
 
 		 436 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  38.35 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  37.44 
 
 		 430 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  40.56 
 
 		 435 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  40.55 
 
 		 429 aa  243  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  41.6 
 
 		 428 aa  242  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  38.54 
 
 		 432 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 		 435 aa  232  9e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  37.56 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  35.1 
 
 		 427 aa  231  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  43.24 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  36.36 
 
 		 430 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  36.36 
 
 		 430 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 434 aa  216  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 431 aa  216  9e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 433 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 		 436 aa  213  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 433 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  34.96 
 
 		 434 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 431 aa  206  7e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 		 434 aa  202  8e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 		 433 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3526  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 427 aa  172  9e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0175987  normal  0.130087 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 433 aa  170  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1839  FAD dependent oxidoreductase  35.01 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.131772  normal  0.38658 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 428 aa  166  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 		 428 aa  166  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  34.84 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  32.43 
 
 		 427 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  32.96 
 
 		 428 aa  163  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 428 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  33.15 
 
 		 428 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 		 434 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  36.29 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  32 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2324  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1539  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 		 442 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1511  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.7 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  32.88 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01278  gamma-Glu-putrescine oxidase, FAD/NAD(P)-binding  32.7 
 
 		 426 aa  161  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2345  FAD dependent oxidoreductase  32.7 
 
 		 426 aa  161  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000869786  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  31.07 
 
 		 437 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1821  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.7 
 
 		 426 aa  161  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01289  hypothetical protein  32.7 
 
 		 426 aa  161  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.667562  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  32 
 
 		 439 aa  161  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1943  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.43 
 
 		 426 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1416  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.7 
 
 		 426 aa  161  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1537  gamma-glutamylputrescine oxidoreductase  32.7 
 
 		 426 aa  160  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.263675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 428 aa  160  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  32.16 
 
 		 427 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  26.46 
 
 		 428 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 428 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  32.79 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1274  hypothetical protein  32.61 
 
 		 428 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2555  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 429 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  32.23 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  31.81 
 
 		 427 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 423 aa  157  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0665  FAD dependent oxidoreductase  31.31 
 
 		 436 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20380  FAD-dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 427 aa  156  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6358  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 		 444 aa  156  8e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 		 426 aa  155  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  33.33 
 
 		 438 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  29.97 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 435 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>