More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0665 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0665  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 436 aa  863    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.205907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4114  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 427 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.776855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0638  putative FAD dependent oxidoreductase protein  34.4 
 
 		 430 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.561447  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2291  FAD dependent oxidoreductase  34.15 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394886 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2366  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 		 431 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3785  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 427 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1462  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 427 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.455561  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0357  FAD dependent oxidoreductase  36.25 
 
 		 429 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.369586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1031  FAD dependent oxidoreductase  34.99 
 
 		 431 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.802473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0214  FAD dependent oxidoreductase  30.02 
 
 		 428 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  0.279288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5257  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 428 aa  179  9e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2389  FAD dependent oxidoreductase  37.59 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1503  putative FAD dependent oxidoreductase  34.3 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0848  putative oxidoreductase  33.51 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.349665  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0126  FAD dependent oxidoreductase  32.24 
 
 		 428 aa  177  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.852563  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5167  FAD dependent oxidoreductase  29.43 
 
 		 478 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547008  normal  0.0506683 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0905  oxidoreductase, putative  33.25 
 
 		 427 aa  176  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4342  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4024  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.488918  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5309  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0571231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 427 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2874  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1437  FAD dependent oxidoreductase  34.49 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4355  oxidoreductase  31.31 
 
 		 428 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0318589  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0551  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.270297  normal  0.259581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2742  FAD dependent oxidoreductase  34.09 
 
 		 432 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6011  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 436 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.414798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1724  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3513  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3730  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6270  FAD dependent oxidoreductase  32.25 
 
 		 436 aa  162  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5578  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 432 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0311057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0184  FAD dependent oxidoreductase  34.9 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1892  hypothetical protein  29.48 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2111  L-pipecolate dehydrogenase  30.14 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4842  FAD dependent oxidoreductase  30.39 
 
 		 433 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3590  FAD dependent oxidoreductase  37 
 
 		 428 aa  156  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0751929 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51040  oxidoreductase  28.64 
 
 		 428 aa  156  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.105475  hitchhiker  0.00000056268 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0897  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.526161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2376  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 427 aa  153  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4014  hypothetical protein  35.79 
 
 		 427 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 425 aa  149  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1037  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 433 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2910  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.451548  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0721  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 430 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4331  putative FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 		 436 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.588243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1148  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0510844 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2126  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 429 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0999299 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4466  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5718  oxidoreductase  30.97 
 
 		 427 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3407  putative oxidoreductase protein  32.29 
 
 		 435 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4992  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 435 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  30.08 
 
 		 430 aa  131  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 427 aa  131  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1539  FAD dependent oxidoreductase  30.9 
 
 		 442 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 427 aa  130  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3316  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 433 aa  130  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  30.08 
 
 		 430 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  30.08 
 
 		 430 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  31.46 
 
 		 430 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2694  hypothetical protein  28.65 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177617  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1120  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2412  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.559875  normal  0.539799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  28.17 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  29.49 
 
 		 430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6091  FAD dependent oxidoreductase  30.03 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  27.6 
 
 		 427 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 427 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  27.34 
 
 		 427 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  27.08 
 
 		 427 aa  126  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1917  oxidoreductase  30.96 
 
 		 424 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  27.91 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5908  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4676  oxidoreductase, FAD-dependent  25.83 
 
 		 427 aa  124  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2636  FAD dependent oxidoreductase  30.96 
 
 		 429 aa  123  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.773353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3951  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 434 aa  123  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00431943  normal  0.112468 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 433 aa  123  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1065  FAD dependent oxidoreductase  26.89 
 
 		 428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1135  FAD dependent oxidoreductase  27.45 
 
 		 428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6592  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 424 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  29.82 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1494  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 		 424 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250769  hitchhiker  0.00298171 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0775  putative FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 425 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.476626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2227  putative FAD dependent oxidoreductase  32.82 
 
 		 434 aa  120  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0806459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2427  FAD dependent oxidoreductase  28.07 
 
 		 427 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0908  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.314062  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 433 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3075  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 		 425 aa  120  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.769709  normal  0.0446875 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 433 aa  120  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 		 428 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  28.13 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  28.13 
 
 		 428 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  26.87 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 440 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>